[求救] clone不出來

看板Biotech作者 (JuneTiger)時間15年前 (2010/09/25 22:39), 編輯推噓2(209)
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2.8K這段我已經有成功接在pGEX上 但是要把他再接進去flag 卻一直接不出來 希望大家可以給我一點建議 我實驗的步驟在下面 希望大家可以幫我看看問題出在哪... 1) PCR 10X buffer 2.5 dNTPs 0.5 Primer-R 0.5 Primer-F 0.5 DNA polymerase(pfu)0.5 DMSO 1.5 ddH2O 18 ->clean up->跑膠(跑起來是single band) 2) 切RE buffer 3 5 ul buffer3 5ul PCR product 15 ul flag(midi) 1ul NotI 1.5 ul NotI 1.5ul SalI-HF 1.5 ul SalI-HF 1.5ul 100X BSA 0.5 ul 100x BSA 0.5ul ddH2O 26.5 ul ddH2O 40.5ul 作用37度,3小時 -> clean up ->跑電泳 3) ligation vector 4 ul DNA 8 ul T4 ligase 1 ul ATP 1 ul buffer 2 ul ddH2O 4 ul 4) Tansformation(DH5alpha): on ice 30min HEAT-SHOCK 42度 90sec on ice 2min LB培養 3hr 塗盤(LB agar Amp) O/N (菌落都沒有長的很大,比較大的約只有0.1cm,大的很少,一盤大約只有10顆以內 很多超小的菌落,不太像衛星,因為是很均勻分布在整個盤子上,應該有幾百顆 ) 5)colony PCR 很小的跟大顆的都有P,都沒有P到我要的東西,但是有P到很多條band P.s有拿空的flag做transform,但是長出來的也是很小的菌落,滿滿的一盤 不知道是不是因為塗盤的時候下太多了?! 希望大家可以幫我指點迷津 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 114.47.66.228

09/25 23:25, , 1F
你的 lagation 應該要寫 insert 跟 vector 的濃度
09/25 23:25, 1F

09/25 23:32, , 2F
flag的vector是lenti的嗎?
09/25 23:32, 2F

09/25 23:41, , 3F
我沒誤會的話你給的全是體積單位..有意義嗎
09/25 23:41, 3F

09/25 23:54, , 4F
沒有測inser跟vector的濃度耶@@ 跑完膠亮度大約是1:2
09/25 23:54, 4F

09/26 00:15, , 5F
flag不是lenti
09/26 00:15, 5F

09/26 15:18, , 6F
你的問題是不是要再那個2.8K的gene前或後端接上flag
09/26 15:18, 6F

09/26 15:19, , 7F
如果是的話,當初我也做過類似的東西,不過我用的是類似
09/26 15:19, 7F

09/26 15:19, , 8F
做shRNA的方法,先訂兩條primer,接著讓他們在高濃度下黏合
09/26 15:19, 8F

09/26 15:20, , 9F
最後黏合出來的產物跟已經切好的PCR product一樣,再將其
09/26 15:20, 9F

09/26 15:20, , 10F
接入。
09/26 15:20, 10F

09/26 21:50, , 11F
樓上的方法的primer要先磷酸化,或是黏好的產物要再磷酸化
09/26 21:50, 11F
文章代碼(AID): #1CdWcDeb (Biotech)
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