Re: [求救] DNA電泳

看板Biotech作者 (我要天天快樂快樂)時間15年前 (2009/07/22 00:08), 編輯推噓1(107)
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※ 引述《yashi (我要天天快樂快樂)》之銘言: : 我是把real-time PCR做完的產物拿來跑電泳 : 取15μL的sample加上3μl的dye : 這次跑出來的sample是β-actin 大小大概是60bp : PCR跑了40個cycle : 膠片是1%的agrose gel : buffer都是1× TBE buffer : 我之前也是照著這個條件跑 : 都有跑出結果來 : 不過最近幾次發現sample都卡在上面下不來… : 但是marker卻分得滿漂亮的 : 現在根本不知道問題出在哪裡 : 覺得很苦惱… : 希望板上有高手可以幫我解決 : 感激不盡!!! : http://www.wretch.cc/album/show.php?i=yashihuang&b=17&f=1299448889&p=3 先謝謝很多人願意幫我一起釐清問題 其實我個人比較傾向是buffer或是sample的問題哎 因為我這個實驗重覆滿多次了 條件都是一樣的 1%的膠100V跑40min 不過之前都沒有這方面的問題 而且這次的sample是real-time完的產物 而我同時也有跑melting curve melting是一個很漂亮的peak 我p完的產物放在-20℃冰箱三天我就跑了 PCR的program也不太可能有人動到… 因為我們實驗室就只有我瘋狂的在跑real-time PCR agrose我也都用一樣的 附帶一題 我的這個照片是用 切膠片用的光箱+數位相機+濾鏡照出來的 所以可能照片跟照膠器照出來的 品質會差很多0rz... 還有我不太了解 所謂的well裡面卡住的是template DNA是什麼意思…?? 是代表我的template DNA加太多 所以反應不完全嗎? 如果是這樣的話可以從real-time PCR的curve或是melting curve看出來嗎? (我覺得如果template DNA很多的話 melting curve應該會很醜吧???) 最後 謝謝大家努力幫我解決!! -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 61.229.148.140

07/22 05:45, , 1F
If your buffer has problem, your marker won't be
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07/22 05:49, , 2F
showed clear.
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07/22 06:11, , 3F
Maybe you should check your PCR reagent
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07/22 06:13, , 4F
If PCR is ok, you will try real-time PCR!!!
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07/22 11:06, , 5F
經過Melting curve後,dsDNA全被打開,很短時間內降溫,
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07/22 11:08, , 6F
常常會亂黏而造成smear。我覺得可以不用跑膠了,不然就
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07/22 11:09, , 7F
別做melting curve。SYBR Safe/Green染小片段效果不佳,
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07/22 11:10, , 8F
試試EtBr。
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