Re: [求救] colony PCR有P到 但定序無結果

看板Biotech作者 (遠道者)時間19年前 (2007/04/06 06:42), 編輯推噓0(000)
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※ 引述《pan7353 (要變成自己喜歡的模樣)》之銘言: : 我想請問一下沒有 transform 的 E.coli 哪來的阿 它不會長在 LBA 上 所以用 LB 養嗎? : 這個步驟是為了確認是不是 P 到 chromosome 嗎? 隨便放一點點(記得,真的要"一點點"!)transformation 用的 competent cell solution 在沒有抗生素的agar plate 上就能得到一堆 : 4.我最後一次定序 就是用兩端 M13 做 colony PCR 結果一樣非常詭異 : 有 p 到兩種片段 一種是預計大小的(快1000bp) 但是非常非常淡 : 另一種很粗很亮 但是不是預計大小的片段 比較小一點(600bp) : 比我的insert(850bp)還小 但是又不到沒有 insert 那麼小 (200bp) : 我把有 p 到 1000bp 的送定序 恩 還是空的 : 然後我把用M13 P到兩種不同片段的菌再用 insert 的 primer p一次 : 然後通通都有 850bp 的片段 這個描述聽起來就是colony 同時有兩種plasmid 的情況 (在假設那個1 kb 是正確product 而非non-specific product 的前提下) 只是我第一次聽到這種正常size 的clone 也能有這種現象 而且size相差這麼小,沒理由amplify 之後那個大的(也就是正確的)pladmid 就完全消失無蹤 (....好吧,我承認我覺得那只是non-specific product) 你的vector only 這麼容易出現 倒不如留意看看enzyme digestion 和 de-phosphorylation 過程有沒有做好 PCR 是個很sensitive 的反應,有時候一些雜訊也不要太鑽牛角尖了 -- 年 輕 的 旅 人 之 歌: 真誠的心,洞悉一切隱藏的美 執著的心,在暗地裡苦苦思索 勇敢的心,無畏無懼 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 62.161.110.208
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