Re: SSR在做mapping的資料..
看板NCHU-AGR00作者flyingdoom (FLYINGDOOM123)時間20年前 (2004/03/12 00:49)推噓0(0推 0噓 0→)留言0則, 0人參與討論串5/9 (看更多)
※ 引述《bundle (寫這是什麼鬼呀 )》之銘言：
: 那是某天我跟阿伯討論 隨便設計一組引子
: 那要如何得知這分子標誌位於哪條染色體的哪一個地方
: 但是如果將全部的基因組全部定序 不是太麻煩了
: 所以結論可以利用原位雜交法
: 你想知道某片段在基因組中的哪一部份
: 可以利用sourthern plot 利用限制脢眉切dna 跑出電泳後
: 其片段就可排列出他的限制圖譜 再利用我想知道的那一片段作為探針
好像是要利用不同酵素去切 然後以類似overlapping的方法去做片段的排序嗎
: 雜合在電泳圖上所能顯影出來的條帶就是我想知的片段的位置
: 但這是適合於質體 病毒 噬菌體等小片段的啦
: 如果是更大一點的 例如低等真核生物
: 其基因組眉切完之後的片段就會複雜
: 要利用到兩組電場就是orthogonal field althernation gel electrophoresis(OFAGE)
: 就可以可能能找出基因位置
: 但是如果是基因組大於5萬kb的 例如較大的哺乳類 或是其他高等真核生物
: 現在技術沒辦法馬上做 但是利用原位雜交法
: 將染色體進行固定 鹼性處理 就可以讓dna鬆散不緊密了
: 再將這想知道的片段 當為探針雜合上去 就可以放射顯影
: 他在染色體的大概位置 這樣一來就縮小了所求的範圍
嗯 我想我還要加強一下這方面技術的知識
: 1 cM相當於百分之一的重組率 這是遺傳圖譜的距離
: 1 bp 是物理圖譜 他是慢慢定序出來的核甘酸長度
: 1 cM是約略相當於1百萬鹽基對 但是不表示它們之間就等於這樣互換
: 只是約略而已
: 你完全解序某一個基因組的核甘酸序列 你只知道序列訊息
: 這是物理圖譜的部分
: 但是你還是不知道哪一部份是有意義的序列 就是說 哪一段序列才是基因
: 這就要藉助遺傳圖譜 才會知道哪裡是有意義的基因座
: 某一基因在這兩種圖譜上的相對基因是一樣的 但是絕對距離就不一樣了
: 兩種圖譜要相輔相成啦
嗯 所以現在進入後基因體(功能性基因)時代
: 我手上有不少篇原文期刊 或是國內的國科會技術報告
: 利用SSR所建立的連鎖圖譜 現在的例子相當多
: 你想要 再跟我借吧
謝了 我搞完專討在跟你借 再向你請教
我的專討搞不太定 有點慘
謝謝詳盡的說明 辛苦你打那麼多字
我想我專討結束後 看一點資料後
可以當面再跟你請教
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