Re: SSR在做mapping的資料..
SSR 是一種重複序列
PCR增幅出來一組重複序列片段 可為一個分子標誌基因座
如果這分子標誌與已知的抗性目標基因是緊密連鎖
我就可以藉由每次都篩選分子標誌
判斷目標作物基因組中是否有我想要的抗性基因
這樣的確選拔很快
但是問題回到原點
首先我需先知道抗性基因在哪裡
或另一方法建立一個飽和的遺傳連鎖圖譜
這圖譜上有相數量的的標誌 平均散佈在整個基因組中
我只要去篩選出抗性與感性品種之間的SSR條帶差異
當然有些標誌篩不出差異 有些可能會有差異
無差異就不談了 那造成的差異部分
有人說改變重複序列的數目導致造成抗性的對偶基因產生
這都是建立在據圖選殖的策略上
就是我已知一組標誌他在遺傳圖譜上的位置
才開始篩選
如果開發一組新的SSR標誌 要分析個體間微衛星序列的長度差異
想知這組微衛星序列在染色體的哪一位置
可能要利用原位雜交法
1980 年原位雜合技術(in stiu hybridization)的建立。
此技術乃直接選取一段基因的DNA以放射線標定，
以此為探針(probe)與展開的染色體進行雜和反應，
這些探針只能選取與之配對的序列成對，
然後再經放射線自動顯影技術，即可確定該基因在染色體上的位置。
--
※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 140.120.190.33
討論串 (同標題文章)
以下文章回應了本文：
完整討論串 (本文為第 2 之 9 篇)：