[求救] miRNA predict (PITA, targetscan..)

看板Biotech作者onerabbit (是時候該冒險)時間13年前 (2013/01/24 13:47)推噓2(2推 0噓 2→)

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剛開始接觸 targetscan 跟ＰＩＴＡ但是對這兩個網站我完全摸不著頭緒也沒人可以問，本身之前也不是做ｍｉＲＮＡ爬文跟google 都沒看到這兩個網站的教學... 也沒人可以問... 有沒有好心人可以教一下 :( 拜託.... 補充問題: 目的: 以CD105(human)為例，我想要找到可以target它的miRNA 過程我先利用 Entrez database去找他的gene symble :ENG 然後我到 targetscan 首頁在2. Enter a human Entrez Gene symbol : 輸入ENG Q1 但在3 的地方我不知道該選什麼，但我看了 broadly conserved/ conserved* /poorly conserved 差異，在這個地方我該怎麼選我還是沒頭緒是要選broadly conserved嘛? Q2 假設在step3 都不選，直接按 submit 進去出現了兩個 NM_000118 (905 nt) NM_001114753 (670 nt) 我卻不知道該怎麼判斷哪一段好，是選較長的嘛? Q3 然後假設點了NM_000118進去後，再來是挑選 mi-RNA 應該是要選conserved 吧， conseved 應該會比poor conseved的好但為什麼他的網站還要列出poor-conseved? -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 223.143.227.120

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HEK293

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onerabbit

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※ 編輯: onerabbit 來自: 219.85.93.15 (01/25 00:19) ※ 編輯: onerabbit 來自: 219.85.93.15 (01/25 00:35)

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hwjuranus

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