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討論串[求救] miRNA predict (PITA, targetscan..)
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#4
Re: [求救] miRNA predict (PITA, targetscan..)
推噓0(0推 0噓 4→)留言4則，0人參與, 最新作者onerabbit (是時候該冒險)時間13年前 (2013/01/27 11:30), 編輯資訊
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謝謝大家的解惑，但我仍然有問題XDD. 若我點了NM_000118進去，我不點View table of miRNA site. 我直接看下面conseved跟poorly conserved 的兩個表格，. 請問我該怎麼選擇哪一個是比較好拿來當做target我的CD105的miRNA，. 因為他有
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#3
Re: [求救] miRNA predict (PITA, targetscan..)
推噓2(2推 0噓 4→)留言6則，0人參與, 最新作者HEK293 (人類胚胎腎細胞293)時間13年前 (2013/01/25 11:25), 編輯資訊
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如果是做人類miRNA，其實conservation的資訊影響不很大。. 只是因為non-coding RNA如果在各物種間的功能一致，一般認為較不受生物. 多樣性影響。所以通常3.這細目我是不設定。. 這兩個accession分別是：. NM_000118.2 endoglin isoform 2
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#2
Re: [求救] miRNA predict (PITA, targetscan..)
推噓1(1推 0噓 0→)留言1則，0人參與, 最新作者RickyKckao (RickyKckao)時間13年前 (2013/01/25 00:53), 編輯資訊
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選broadly conserved就好. miRNA target site的序列在物種間可能有保留性. 你選擇conserved的話只會顯示target site在物種. 間距保留性的miRNA出來. 出現兩個以上的原因是該gene可能有alternative. splicing, 你可能要確定
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#1
[求救] miRNA predict (PITA, targetscan..)
推噓2(2推 0噓 2→)留言4則，0人參與, 最新作者onerabbit (是時候該冒險)時間13年前 (2013/01/24 13:47), 編輯資訊
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剛開始接觸 targetscan 跟ＰＩＴＡ. 但是對這兩個網站我完全摸不著頭緒. 也沒人可以問，本身之前也不是做ｍｉＲＮＡ. 爬文跟google. 都沒看到這兩個網站的教學.... 也沒人可以問.... 有沒有好心人可以教一下 :(. 拜託..... 補充問題: 目的: 以CD105(human)
(還有678個字)
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