Re: [求救]請問PCR products用restriction enzymeꐠ…

看板Biotech作者 (Anita~)時間17年前 (2008/08/14 11:04), 編輯推噓2(206)
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※ 引述《albertwang (會思考的魚)》之銘言: : ※ 引述《calmato (Anita~)》之銘言: : : 不好意思~因為我是第一次接觸分生~很多東西都是自己try 或找資料或問人~所以有很多東西~不知該怎麼問或該注意什麼 ~所以真的很不好意思~遇到很多問題卻自己一直沒法解決 >"< 廠商給的information 是只有說 To make 100uM stock solution add 255 ul of buffer 我的working primer是從這裡面取10ul primer + 90 ul water 那我把我的所有try的條件po上來~但不知道這樣是不是您說的反應條件? 跑PCR ,total volume 30,water 19.85,primer Forward and reverse 各1,10x dNTP 3,10xPCR buffer 3 ,Taq 0.15 ,Template DNA 2 以上單位都是ul。但我的DNA濃度品質不一~OD從 40~800 ng/ul 使用restrition enzyme: PCR products 5,water 16.4,10x Buffer 2 50X SAM 0.6,enzyme 1;total volume 25,使用的廠牌是Fermentas 它的protocal是PCR reaction mixture 10ul(~0.1-0.5ug of DNA) water 18 ,10X Buffer Tango 2,50XSAM 0.6,enzyme 1-2 因為考量到我的PCR products加10會切不完整,~所以才加5,但照我的想法 我的DNA量不算太少,切出來應該會很清楚,但不知為何拍出來照片都很淡 我一直找不出原因。 也想請問您剛說用酒精沉澱,是如何做呢? 以上很冗長,感謝您的指教!! -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.128.68.5

08/14 11:25, , 1F
其實純化DNA kit也沒有很貴說,用這個比較方便啦
08/14 11:25, 1F

08/14 11:26, , 2F
酒精沈澱就是加絕對冰酒精跟高鹽溶液(詳細比例忘了..)
08/14 11:26, 2F

08/14 11:28, , 3F
然後放冰上久一點,DNA就會沈澱下來...不過這樣primer還是無
08/14 11:28, 3F

08/14 11:28, , 4F
法去除說...而且你的片段很小,可能也不好沈澱吧
08/14 11:28, 4F

08/14 23:25, , 5F
酒精沉澱加入兩倍體積100%酒精,放1-2小時後離心,再加70%酒精
08/14 23:25, 5F

08/14 23:27, , 6F
wash DNA ,1/10 3M NaOAc可加可不加(100%沉澱效果不好再加)
08/14 23:27, 6F

08/14 23:30, , 7F
另外要切Product的話最好確定每次切的量有1ug以上
08/14 23:30, 7F

08/14 23:30, , 8F
還有想請問一下切完你要作什麼呢?(好奇
08/14 23:30, 8F
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