Re: [方法] 如何對plasmid做site-directed mutation ?
其實做site direct mutagenesis方法還蠻多種的,
這個方法還不錯用
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(RE1)----> ---->
RE1------------------X------------------RE2
<---- <----(RE2)
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A: (RE1------------------X---)
B: (---X-------------------RE2)
C: (RE1------------------X-------------------RE2)
1st PCR: 分別做 primer 1 及 primer 2, primer 3 及 primer 4
得product A 及 product B (template source: target plasmid)
要將product cut and purify
2st PCR: 分別做 primer 1 及 primer 4
得 product A、B、C (template source: product of 1st PCR (1:1)
取product C--->purify, cut by RE1 and RE2
將target plasmid for SDR, cut RE1 and RE2 (取長段,短段為置換)
Ligation---transformation--->colony identification by sequencing
Note:RE1-------RE2的長度當然愈短愈好,一般大概三到五百bp
RE1及RE2最好是unique site (避免cut vector)
primer 2,3 design部分最好要變的點在中間,前後各延長10~15bp
GC結尾,specificity較高
以上我常用的方法,另外還可以用PCR的方法跑一整圈plasmid,
然後用Dpn1 cut 再接,實驗室有人做,應該是ok
有需要再提供給大家好了...我也沒實際試過 ^^""
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