Re: [問題] 人類有能力用電腦模擬找出新材料來嗎
模擬新的材料我是不太清楚,但是找化合物我是有點相關的經驗
我在國家衛生研究院工作過,曾經負責過一個案子就是要去跑
分子動力模擬(molecular dynamic simulation)然後利用其中的結果去預測
化合物的結合能力,這在醫藥領域是相當常見且熱門的項目之一
但我不得不說,這些預測出來的結果經常會跟實驗結果會有不小的出入
很大的原因是出在說這些分子動力模擬都是用數值解去解這些微分方程
,但是只要是用數值解去處理微分方程,就一定會碰到甚麼蝴蝶效應
混沌理論的這些東西跑出來,而且這些是"不可能去避免的"。
再來,就是處理問題所使用的方程式,有時候會為了降低計算的複雜程度
會去把這個問題簡化,譬如說距離只要超過100 nm,就不去計算彼此間的作用力
之類的,但是自然界就是這樣運行的嗎? 應該也不是
只是有時候為了快速看到結果,只好犧牲一些精確度,但是這又不會造成數值解發散?!
其實也不知道。如果有一百種化合物要測試,不可能一個模擬項目就跑一個月,
這樣也太誇張了,所以不管如何,其實這些MDS 當然是有參考價值,但是你說只靠模擬
而不用實驗,我們離這樣的目標應該還有一段距離要走
有興趣了解的話,可以去google Gromacs, 我當初就是用這套免費軟體去跑的模擬
我當初有去讀了些shadow hamiltonial paper,但其實也沒有很懂,只知道模擬出來的東
西一定會有一些fluctution 或是 drift之類的 XDXD...但這也是"大概"說明了為何模擬
為何不能完全取代實驗
https://bionum.cs.purdue.edu/EnSD05.pdf
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