Re: [求救] 有沒有人用過gel filtration???

看板Biotech作者 (熱騰騰的泡麵)時間14年前 (2011/05/02 18:02), 編輯推噓4(4019)
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原文恕刪 參考了sephadex產品說明書 其中一段如下: Use 0.15 M NaCl or a buffer with equivalent ionic strength to avoid pH dependent nonionic interactions with the matrix. At very low ionic strength, the presence of a small number of negatively charged groups may cause retardation of basic proteins and exclusion of acidic proteins. 根據以上我的解讀是column的metrix是dextran, 帶有負電荷OH group,在極低的離子強度 假如sample帶有正負電荷都會和metrix產生吸附或是排斥現象.因此必須要使用0.15M鹽類 增加buffer的離子強度,減少sample與metrix的交互作用. 另外有提到 When working with a new sample, try these conditions first: 0.05 M sodium phosphate, 0.15 M NaCl, pH 7.0 or select the buffer into which the product should be eluted for the next step (e.g., further purification, analysis, or storage.) 意即使用時建議先試試看0.05M sodium phosphate + 0.15 M NaCl 問題來了!之前使用的buffer組成為D-PBS,本身緩衝濃度Sodium Phosphate Dibasic 8.10 mM, Potassium Phosphate Monobasic 1.47 mM, Sodium Chloride 138 mM 分離結果是看不到後面的小分子elute out 問題1:若改為說明書建議的配方, NaCl濃度沒差多少,而是差在緩衝溶液的濃度(50 mM)會不會 對於我的分離結果會有改善呢 問題2:我的大分子是SOD,在pH 7.4環境下應該不會帶特定電荷, 還需要這麼高(0.15M) 鹽類嗎? 由於sample快沒了 每一次的使用都盡量力求效率 請有經驗的大大指教!!! -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 210.60.122.10

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鹽濃度和分離效率無關 只要你的東西可以流的出來就好
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我沒特別加NaCl 用這種column也是可以分離 關鍵是你的溶
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液的離子性夠大到讓你的蛋白不會黏在管柱上
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你可以先try 只打buffer進去看小分子什麼時候流出來
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05/02 20:24, , 5F
還沒聽過小分子也流不出來的 既然你用手動 你怎麼detect
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你的小分子?
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照你的講法是用手動 你用導電度計測變化?
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05/03 01:09, , 8F
回j大 利用UV detect
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所以j大之前的buffer是只有sodium phosphate不含NaCl囉?
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前兩篇已經說明了 280nm吸收看不到glutathione
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就算是用214, 220nm這些對有單鍵的東西吸收都很高 看不
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到變化也是正常的
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05/03 18:05, , 13F
目前想法是看230附近的吸光值,因為buffer不太會有吸光值,
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假如打純的GSH看到後面fraction在230附近有吸收,我也可以
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認定大小分子確實有分離
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您為何不加glutathione到buffer裡 看看吸光值有何變化
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但我不太認為你會看的到
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想了一下 搞不好可以
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我只是很好奇你為什麼會想用吸收值來看它
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230不是一個很好的地方啊 頗少看到人看這個點
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如果你看到說明書 大概都是在用導電度看 最直覺
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收集的fraction自然就有GSH+buffer,另外想用UV的原因是想
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05/03 19:15, , 23F
看到大分子小分子有先後分開的peak
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文章代碼(AID): #1Dle4mP6 (Biotech)
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