Re: [求救] 抽DNA跟跑電泳的問題

看板Biotech作者 (雅)時間16年前 (2008/09/11 19:14), 編輯推噓2(202)
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※ 引述《hsin1106 (過於喧囂的孤獨)》之銘言: : 最近剛進實驗室開始做實驗 : 在抽DNA跑agarose gel時碰到了幾個問題 : 1.我的gel照UV的時候 頂端會整個偏白色 : 比較上面的band會被蓋過去 不容易判讀 會不會buffer太髒,或者gel配太久了?? 如果片段太大可以降低agarose %數 : 2.用BamH和NdeI切我的plasmid時 : 我的比例是 兩種酵素 各加1μl : DNA 7μl 跟 1μl 10X 的buffer : DNA量比較多的話就等比例增加 : 之後再37度下反應兩個小時 : 可是跑完電泳 甚麼都看不到 : (marker跟未切拿來當control的都有band) 各loading的量? 未切的和已切的各loading多少? : 3.我的plasmid 是pET-15b : 通常在菌液OD=1.5上下時用VIOGENE的kit抽 : 抽出來的DNA稀釋10倍測260nm大概都在0.03~0.05之間 : 這樣的量是不是偏少?? 是的話 有哪些可能會影響?? 濃度應該用核酸測定儀測吧 不然可以對照marker的量 記憶上以前測過1mL的菌液萃取,好像頂多0.6~0.9 ug/ul吧 好像很難超過 1ug/ul (不曉得有沒有記錯.....) 我是用kit抽的 還有plasmid的量跟copy number應該有關吧 : 麻煩板上的各位 提供可能的原因 : 或者有哪些資料可以參考的 : 讓我可以試著排除問題 : 不然實驗一整個沒辦法繼續下去 : 先謝謝各位了 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 118.161.185.222

09/11 23:36, , 1F
1mL菌液有多少濃度取決溶於多少體積,你這樣說會沒人看得懂
09/11 23:36, 1F

09/12 00:18, , 2F
喔 elution體積約35~50ul
09/12 00:18, 2F

09/12 00:43, , 3F
你一定標錯了,1ml不可能抽到~30ug的plasmid,約3ug才差不多
09/12 00:43, 3F

09/12 00:45, , 4F
你可找一些資料看看,1ml菌液,high copy約有2~7ug的plasmid
09/12 00:45, 4F
文章代碼(AID): #18oFsmuN (Biotech)
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