Re: [問題] 偽基因
※ 引述《aeroufo (神手~~)》之銘言：
: ※ 引述《PlanktonEvil (邪惡皮老闆)》之銘言：
: : pansci前陣子一篇文章，大約3%左右的DNA是合成蛋白質，
: : 大約80%左右都是負責決定什麼時候合成什麼蛋白質，
: : 剩下約有10%左右則是沒有明確功能。
: : 不過這還是不能說明"為什麼"就是了...
: : 如果上帝是一個程式設計師，那他大概很喜歡複製程式來用，所以do的指令只用了3%，
: : 有80%都是在寫if，然後10%可能是註解，或是隨時可以拿來小改一下程式... :D
: 如果你是專業寫程式的，我用這樣的講法來解釋你可能就可以理解為何在生物的基因
: 裡，大部分是所謂的偽基因，目前知道的基因鹼基是由ATCG四種所組成的，生物演化
: 最主要的理論中，關於基因的序列，並未有一個最原始的模板(也就是所謂的上帝)，
: 所以到底這些基因是如何組起來的，你就把它當作大樂透好了，雖然只有四個鹼基，
: 但是中獎的號碼長度不等(轉譯蛋白質的序列)，隨機取樣，請問你的中獎率會有多高
: ??而要怎樣的買家才能夠在演化中活下來??就是你要中獎好幾次並且保留這些序列的
: 買家才會留下來(存活)，可是你大部分沒有中獎的序列仍會被保留(目前稱偽基因)，
: 所以能夠有3%的中獎率是不是很高呢??但是在科學家不斷的研究下，也發現那些沒法
: 轉譯出蛋白的序列仍有很多是有生物意義的，所以真正有生物功能的基因有多少還是
: 未知數，所以如果你用寫程式來比喻基因的演化是比較不恰當的，最原始的基因模板
: ，以目前最主流理論來說應該屬於隨機取樣，當然這個隨機取樣還要考慮鹼基彼此的
: 親和力不同。
: P.S 這是非常簡單化的比喻，因為最原始的模板比較可能是單股RNA而非DNA
: P.S 2 如果你要用有原始模板，然後才開始進行演化的想法，那就是另一種說法外星
: 生物說，地球的生命是由一顆隕石帶來的，或地球是外星人的試驗場(好玄壓)
: 最後抱歉因為在上班沒法太詳細解釋^^，還有科學不是不能假設的，只是要合理的假設
: 所以說我最後才會說如果你認為是像上帝寫程式，那就是比較傾向外星生物論，而目前
: 許多的研究越來越印證這些鹼基是可以在原始地球環境下自行形成有功能的序列。
感謝你詳細的解釋，突然想到一個有趣的議題，基因的演化可能不是個體最佳化，
而是群體最佳化的結果，甚至基因對生命也是自私的，只想延續自己本身的資訊。
以生命週期為例，如果縮短生命週期，對這個基因資訊的延續下去是有利的，
那基因不惜代價讓自己朝短壽命的方向演化...
不過這種思考方式也會有個怪異的現象，
初期地球的生態系統是否應該維持在低階的生命型態最為穩定？
因為短週期，更有效率的使用能量使自我的資訊被大量複製，應該是最佳解，
不過也有可能就像一個金字塔的結構一樣。
每一種基因組成如果想像成一個大籠子裡彈跳的兵乓球，
每個兵乓球都在底部附近彈跳是最穩定的，但是當兵乓球變多後，
球跟球之間互相碰撞，動能轉換，於是就開始有機會某些球突然彈的比其他的高，
出現與"盡可能使用較少的能量，複製越大量的自身資訊"這種原則相牴觸的躍遷，
只要物種與數量越多，就越可能發生這種，把某些球彈到更高位置的意外...
也許可以更廣義的定義，基因型態的組成方式，然後用電腦做仿生物演化測試，
改變不同的基因組成比例，而要發生這種彈跳的門檻數量與機率是否有所不同，
我會想到把3%的do當功能型不容易變異的部分，70%的if當作變異強度，
不過系統的數量增長應該怎麼假設，還沒想到... a_a"
PS:也許這種彈跳模型，解釋為何要浪費多餘的能量，複製一些沒有功能的基因，
因為彈跳是沒有目的性的，而有功能是彈跳運氣的結果。
※ 編輯: PlanktonEvil 來自: 140.116.205.180 (09/16 18:12)
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