Re: [問卦] 基因定序的原理?

看板Gossiping作者 (*~亞比醬~*)時間4年前 (2021/09/08 15:27), 4年前編輯推噓17(17019)
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※ 引述《fifthfloorme (躌艛)》之銘言: : 標題: [問卦] 基因定序的原理? : 時間: Wed Sep 8 14:44:42 2021 : : 小妹文組,想問基因定序為什麼要那麼多天? : : 我以為就是把基因拿去顯微鏡底下觀察一下欸!生物課不是都有萃取過DNA嗎? : : 還是說,要放大很多倍才能看得清楚序列呢?求解! 關於基因檢測的相關全條目,初版是我10年前寫的,好像沒被其他編輯者改多少: https://reurl.cc/EZK4eA 基因定序 https://reurl.cc/aNlLDX 歡迎內行的各位幫忙編修~ ^^ 這邊我要挑一點特別提出來給各位版友認識,基因定序之父是台灣人: 陳弈雄博士 : → Goog1e: 生物課萃取DNA?????? 150.116.147.25 09/08 14:45 現在的萃取DNA實驗,已經到小學生自然課就有做過了喔~ : 推 Neisseria: 用定序儀跑的。要跑一至兩週 112.105.246.64 09/08 14:48 不用,純做實驗、上機跑數據的話,一天以內(正確來說,幾小時內)就出來了~ 整個過程最花時間的是採樣送件及確認受檢者的"跑病例流程"階段。 <=人文的 問題永遠比做科學的實驗還複雜。 現在科技進步很快,基因定序儀已經到第四代了,一個人的"全基因圖譜"才需要 跑到幾天。 : → SRadiant: 跑1、2週是20年前的事吧... 111.82.244.251 09/08 14:49 10年前的事.... 20年前是多個國家,上百的研究團隊跑了數年。 現在科技進步很快的。 ^^ : 推 vaya: 推 要用電顯。 選我正姐 39.11.36.226 09/08 14:51 電顯也看不到"分子"層次,DNA可是分子鏈.... : 推 owlonoak: 20年前還沒有完全定序這種技術 220.143.192.200 09/08 14:51 嗯.... 也不是這麼說...... : 推 Neisseria: 所以現在定序要多久?一至三天? 112.105.246.64 09/08 14:52 做實驗不用,但整個流程(含採檢、送樣、實驗、上機、出報告....等全部)可能要。 : 推 LukaDoncic: 要先RT 再PCR 再送NGS 再用程式分析se 35.130.71.243 09/08 14:52 RT跟PCR是一起的.... 而且真有需要用到RT? : → SRadiant: 記什麼,因為有3萬個左右所以要花一些 111.82.244.251 09/08 14:52 : → SRadiant: 時間 111.82.244.251 09/08 14:52 : → LukaDoncic: quence 可能還要重複幾次 35.130.71.243 09/08 14:52 : 推 scps990607: 搜尋「次世代定序NGS」了解一下 27.242.135.137 09/08 14:53 GJ ^^ : 推 kavengany: DNA電泳慢慢跑 223.139.161.184 09/08 14:53 這實驗不用跑電泳。 : 推 gn01657736: DNA才問世30年,技術還不成熟一堆文 49.217.198.4 09/08 14:53 看你說的技術是哪種... 比如剪接的技術確實還不純熟(基因治療)。 但論定序,它的發展已經很久、很熟了。 : → gn01657736: 組,ATGC就一堆人就看不懂了 49.217.198.4 09/08 14:53 : → SRadiant: 病毒幾萬個鹼基完整定序沒問題啊 111.82.244.251 09/08 14:54 沒錯~ 不過PCR永遠有個問題,就是在複製的時候會出錯。 : 推 owlonoak: 其實上面有一個鄉民還真的說對了 220.143.192.200 09/08 14:54 : → owlonoak: 真的是叫DNA排好報數 220.143.192.200 09/08 14:54 : → owlonoak: 是長度從一個鹼基到最後一個鹼基這樣 220.143.192.200 09/08 14:55 : → owlonoak: 檢查這一堆長度不等的DNA的最末端鹼基 220.143.192.200 09/08 14:55 : → owlonoak: 這就是目前定序的原理 220.143.192.200 09/08 14:56 : → SRadiant: NGS出來也快20年囉,2003年就有發表一 111.82.244.251 09/08 14:56 : → SRadiant: 個腺病毒全基因組 111.82.244.251 09/08 14:57 10年 : 推 duckie: Sanger定序法 應該不會用到NGS 60.251.121.124 09/08 14:57 : → duckie: NGS太貴了 60.251.121.124 09/08 14:57 你內行!! : 推 pastoris: 採後萃取蛋白質體,用delta序列當引子作 150.116.67.54 09/08 14:58 : → pastoris: PCR,結果sequence分析 150.116.67.54 09/08 14:58 ...... 翠蛋白質體???? 你確定???? (@_@)? : → SRadiant: 病毒基因體很小,不貴,而且公家的錢 111.82.244.251 09/08 14:58 只要做分子實驗,沒有不貴的~ : 推 pastoris: 那會用什麼作primer夾出來? 150.116.67.54 09/08 15:03 : → SRadiant: https://i.imgur.com/oKP7BNV.jpg
111.82.244.251 09/08 15:03 : → SRadiant: 台灣不知不覺也上傳一堆序列了,剛剛還 111.82.244.251 09/08 15:04 : → SRadiant: 看到有人說定序會不會造假... 111.82.244.251 09/08 15:04 : → SRadiant: https://i.imgur.com/7SnEEYq.jpg
111.82.244.251 09/08 15:04 : → SRadiant: 有些資訊比較齊全的,會有定序技術,像 111.82.244.251 09/08 15:05 : → SRadiant: 這個是用Illumina Iseq 111.82.244.251 09/08 15:05 : → SRadiant: Illumina iseq 100的話就是NGS 111.82.244.251 09/08 15:07 你內行~ GJ~ ^,^ -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 202.39.33.67 (臺灣) ※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Gossiping/M.1631086076.A.CF5.html ※ 編輯: yabia (202.39.33.67 臺灣), 09/08/2021 15:28:41

09/08 15:28, 4年前 , 1F
我印象啥小sanger法
09/08 15:28, 1F

09/08 15:28, 4年前 , 2F
大神
09/08 15:28, 2F

09/08 15:28, 4年前 , 3F
你太專業了
09/08 15:28, 3F

09/08 15:32, 4年前 , 4F
09/08 15:32, 4F

09/08 15:33, 4年前 , 5F
請問要怎麼分離人和病毒的DNA呢
09/08 15:33, 5F

09/08 15:34, 4年前 , 6F
更正,應該是RNA?
09/08 15:34, 6F
有特定序列可以用primer夾,跑電泳切膠、PCR...等,我懂得是老套的做法,需要 RNA的量比較大,不然光過程就被降解掉一堆了,以前做RNA的研究的人很辛 苦。  現在有很多KIT可以用,不需要我懂得那種老方法了,你可以去查一查 一些廠商提供的RNA KIT。

09/08 15:36, 4年前 , 7F
我生化被當的咖QQ
09/08 15:36, 7F
分生是現在的科科人的顯學,你生化不好好讀,分生就別想過了....

09/08 15:49, 4年前 , 8F
不需要RT嗎? 冠狀病毒不是RNA病毒嗎?
09/08 15:49, 8F

09/08 15:50, 4年前 , 9F
還是現在RNA也可以直接pcr?
09/08 15:50, 9F

09/08 15:50, 4年前 , 10F
不是討論病毒基因體嗎?你說幾十個國家
09/08 15:50, 10F

09/08 15:50, 4年前 , 11F
那是人類基因體
09/08 15:50, 11F
喔,我以為你在談"歷史",在講之前的人類基因體的事.... 病毒基因體小,很容易測完,但要抓有意義的片段就好,多抓的是沒意義的~ 反而干擾你做研究分析~

09/08 15:52, 4年前 , 12F
10年前病毒基因體1、2天就有,不用1~2週
09/08 15:52, 12F

09/08 15:53, 4年前 , 13F
分生是20年前科科人的顯學,現在就基本功
09/08 15:53, 13F
也對啦~ 現在是基本功了~ 時代的眼淚~ (Q_Q)

09/08 15:54, 4年前 , 14F
要RT
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我以為已經有新產品可以替代這老方法了.... 現在還是要RT啊... (=..=) 沒有我想像中的進步得快啊....

09/08 16:08, 4年前 , 15F
自從human genome proejct 完成之後 科科
09/08 16:08, 15F
你也不想想該內容是我10幾年前寫的~ 既然是內行人,有空幫我編修啦~

09/08 16:08, 4年前 , 16F
現在能不轉成cDNA就PCR?
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09/08 16:09, 4年前 , 17F
人改玩各種 -omics 然後又回到整體論層次
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09/08 16:09, 4年前 , 18F
有one step RT-PCR臨床有沒有用不知道
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09/08 16:09, 4年前 , 19F
的生物學研究
09/08 16:09, 19F

09/08 16:10, 4年前 , 20F
我只是好奇同時做你要怎麼分離RNA RT可以特
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09/08 16:11, 4年前 , 21F
別辨識polyA tail
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※ 編輯: yabia (202.39.33.67 臺灣), 09/08/2021 16:12:38

09/08 16:11, 4年前 , 22F
因為你抽的時候也得到非mRNA的東西
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09/08 16:23, 4年前 , 23F
第四代?我只認識第三代nano pore? 第四代
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09/08 16:23, 4年前 , 24F
不是還在開發中 商用了嗎?
09/08 16:23, 24F

09/08 16:53, 4年前 , 25F
RNA抽出來不RT會不會很容易裂解,應該不會
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09/08 16:53, 4年前 , 26F
有人這麼勇敢吧
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09/08 16:54, 4年前 , 27F
人文(x) 人為/人事/行政流程(o)
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09/08 16:56, 4年前 , 28F
病毒基因體小,確實(比較)便宜啦!
09/08 16:56, 28F

09/08 16:56, 4年前 , 29F
09/08 16:56, 29F

09/08 16:59, 4年前 , 30F
如果是PCR我懂一點,萃取病毒的RNA後
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09/08 16:59, 4年前 , 31F
會轉錄成DNA再進行PCR
09/08 16:59, 31F

09/08 17:25, 4年前 , 32F
英國變種的源頭抓到但媒體都不報
09/08 17:25, 32F

09/08 17:33, 4年前 , 33F
專業推
09/08 17:33, 33F

09/08 18:13, 4年前 , 34F
推專業文
09/08 18:13, 34F

09/08 18:43, 4年前 , 35F
電顯當然看得到分子,只是不會用來定序
09/08 18:43, 35F

09/08 22:23, 4年前 , 36F
可以敲碗下一篇文章嗎!!! 敲敲!!
09/08 22:23, 36F
文章代碼(AID): #1XE6Nypr (Gossiping)
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