Re: sonication做大片段的碎片
※ 引述《leondemon (狗狗)》之銘言:
: 目前我的genomic DNA要做sonication
: 但是跟一般ChIP不一樣的是:DNA片段大小不同
: 我目前獲得的genomic DNA主要的大片段有兩種:3100Kb和282Kb
: 但是我希望它們碎片化的長度為:20~150Kb之間
: 於是似乎sonication就變得非常困難 因為要控制變成那麼長的片段似乎不容易
: 於是來問問看有沒有什麼技巧 可以避免過度碎片化 並保持碎片的長度範圍穩定?
: 另外要確定長度 是否一定就要使用pulse field Gel electrophoresis?
: sample準備或是進行過程有要注意的嗎?
突然想起 利用syringe 好像可以破細胞和gentle降低lysate viscosity(DNA斷碎)
這樣應該就不用sonication了
但是我沒用通過syringe 不知道要用多少G的針頭比較適合?
有人有通syringe的經驗嗎?
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