Re: sonication做大片段的碎片

看板Biotech作者 (狗狗)時間16年前 (2008/07/02 13:59), 編輯推噓0(000)
留言0則, 0人參與, 最新討論串4/4 (看更多)
※ 引述《leondemon (狗狗)》之銘言: : 目前我的genomic DNA要做sonication : 但是跟一般ChIP不一樣的是:DNA片段大小不同 : 我目前獲得的genomic DNA主要的大片段有兩種:3100Kb和282Kb : 但是我希望它們碎片化的長度為:20~150Kb之間 : 於是似乎sonication就變得非常困難 因為要控制變成那麼長的片段似乎不容易 : 於是來問問看有沒有什麼技巧 可以避免過度碎片化 並保持碎片的長度範圍穩定? : 另外要確定長度 是否一定就要使用pulse field Gel electrophoresis? : sample準備或是進行過程有要注意的嗎? 突然想起 利用syringe 好像可以破細胞和gentle降低lysate viscosity(DNA斷碎) 這樣應該就不用sonication了 但是我沒用通過syringe 不知道要用多少G的針頭比較適合? 有人有通syringe的經驗嗎? -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.129.77.13
文章代碼(AID): #18QnbQDS (Biotech)
文章代碼(AID): #18QnbQDS (Biotech)