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kaofei 在 PTT 最新的發文, 共 228 篇

[討論] 生物安全操作櫃選擇

[ AfterPhD ]2 留言, 推噓總分: +1

作者: kaofei - 發表於 2024/04/01 12:51(1月前)

[求救] 抽genomic DNA無法去除RNA contamination

[ Biotech ]3 留言, 推噓總分: +1

作者: kaofei - 發表於 2020/06/14 23:03(3年前)

[求救] polyadenylation troubleshooting

[ Biotech ]0 留言, 推噓總分: 0

作者: kaofei - 發表於 2020/03/25 21:40(4年前)

[問題] paper刊出後發現錯誤

[ AfterPhD ]10 留言, 推噓總分: +3

作者: kaofei - 發表於 2020/01/13 21:48(4年前)

[求救] NGS data分析

[ Biotech ]61 留言, 推噓總分: +11

作者: kaofei - 發表於 2018/09/25 18:54(5年前)

kaofei 在 PTT 最新的留言, 共 828 則

[問題] paper刊出後發現錯誤

[ AfterPhD ]10 留言, 推噓總分: +3

作者: kaofei - 發表於 2020/01/13 21:48(4年前)

10^F→kaofei: 是不會影響到結論，數字的應該也還好，明白了，謝謝大家！01/15 10:59

[求救] NGS data分析

[ Biotech ]61 留言, 推噓總分: +11

作者: kaofei - 發表於 2018/09/25 18:54(5年前)

5^F→kaofei: 回一樓，對host read就是宿主的sequence09/26 00:50

6^F→kaofei: 想請問二樓為什麼不認為可以組出高品質的genome？09/26 00:51

7^F→kaofei: 移除host reads後我們實驗的兩種病毒剩下的Reads分別是09/26 00:51

8^F→kaofei: 26跟48%左右，coverage也都有1000以上，這樣也無法保證嗎?09/26 00:53

25^F→kaofei: 回lingon大大，其實我在看對方給的data時有個疑問，就是09/26 22:12

26^F→kaofei: de novo組出的contig對回ref.相似度有99%以上，但是如果用09/26 22:12

27^F→kaofei: non-host reads回貼ref.時，百分比卻降到60-70% 這合理嗎?09/26 22:13

36^F→kaofei: 謝謝大大們的解釋。想在問一個問題，就是我們在定序病毒09/28 08:16

37^F→kaofei: 兩端的時候發現序列都會不正確大約各少10個mer左右，這是09/28 08:17

38^F→kaofei: NGS定RNA的限制嗎，我們的病毒是有5' cap跟3' polyA tail09/28 08:18

54^F→kaofei: 我們跟實驗室合作，我們只負責純化足量的RNA，後續library09/29 15:15

55^F→kaofei: 製備跟其他的就是對方實驗是負責了。會問這個問題是我發現09/29 15:16

56^F→kaofei: 序列有出入後跟對方實驗室問，他們過去也有做過一個ss+RNA09/29 15:17

57^F→kaofei: 病毒也有類似的狀況，去查了其他的paper才發現這似是常態09/29 15:18

58^F→kaofei: 所以如果想用NGS定病毒全長，還是要搭配其他的技術才能獲09/29 15:19

59^F→kaofei: 得兩端的序列因對方實驗室也不清楚為什麼所以上來問問XD09/29 15:19

[求救] macrophage毒殺能力測試

[ Biotech ]14 留言, 推噓總分: +5

作者: satan317 - 發表於 2018/03/06 04:01(6年前)

7^F推kaofei: 樓上是讓你去跑flow 如果不想跑也可以讓MQ吃yeast然後用03/11 18:27

8^F→kaofei: 眼睛看有些dye可以幫你區別yeast是活還是死，換言之你出03/11 18:27

9^F→kaofei: 來看吞噬能力，還看真的“毒殺”能力03/11 18:27

10^F推kaofei: 出來-->“除了”03/11 18:28

[求救] Picodrop台灣代理商

[ Biotech ]2 留言, 推噓總分: +1

作者: kaofei - 發表於 2017/11/25 13:51(6年前)

2^F→kaofei: 喔喔喔喔謝謝樓上!!11/26 22:31

[求救] 有人將ligation mix不小心凍去-20過嗎

[ Biotech ]9 留言, 推噓總分: 0

作者: kaofei - 發表於 2017/10/04 21:49(6年前)

2^F→kaofei: 我也是這樣想的…，但實在是沒發生過類似的事所以有點緊張10/04 22:12

3^F→kaofei: orz10/04 22:12

6^F→kaofei: 我放4度作用，都直接丟冷藏…只是那時候想太快以為自己要c10/05 20:29

7^F→kaofei: hloroform extraction了…就進-20了10/05 20:29

9^F→kaofei: 有耶好像影響不大，覺得走運…10/06 15:13

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