[問題] cluster雙CPU設定

看板Linux作者 (走走)時間9年前 (2015/06/18 15:34), 9年前編輯推噓6(6推 0噓 25→)
留言31則, 9人參與, 最新討論串1/2 (看更多)
想要請教一下 之前舊的實驗室cluster的子機 本來都是用六核心單CPU 最近買了新的子機 是兩個六核心的CPU 可是安裝完成之後 跑起來的效能和單CPU的一樣 想請教一下 cluster雙CPU有需要做甚麼特別的設定 才能順利用雙CPU做平行計算呢 我們是使用openmp的平行化方式 謝謝 -- 每年的耶誕節　我只許一個願 我希望　我愛的人　有一天能夠愛我 其實　一個人的生活也不算太壞 只要自己想得開的話 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 140.112.182.160 ※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Linux/M.1434612854.A.B20.html
推
06/18 20:51, , 1F
個人認為你這樣描述資訊過少，若有點CPU資訊，以及你觀察到
06/18 20:51, 1F
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06/18 20:51, , 2F
的狀況會比較容易理解你遇到的問題。
06/18 20:51, 2F
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06/18 23:22, , 3F
cpu是 2* XEON E5-2620 比上兩年前買的i7 6核心 型號忘了
06/18 23:22, 3F
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06/18 23:23, , 4F
簡單來說就是兩個CPU和一個CPU跑完一組平行計算的時間一樣
06/18 23:23, 4F
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06/18 23:23, , 5F
所以我在想是不是新的電腦設定錯誤
06/18 23:23, 5F
推
06/18 23:34, , 6F
一般來講，你只要啟動的是SMP KERNEL就夠了，至於平行
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06/18 23:35, , 7F
演算的效能並不是單純你用了哪一個KIT就一定能凸顯的
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06/18 23:36, , 8F
多核心程式需要注意的很多，但單純從您的說法裡面可以
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06/18 23:37, , 9F
推測的資訊其實很貧乏：是否有適當分割演算，演算是否
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有不當的相依關連，甚或邏輯性的等待拴鎖等等.....
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06/18 23:38, , 11F
搞不好ram吃滿了，所以沒有辦法跑那麼快XD
06/18 23:38, 11F
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06/18 23:38, , 12F
之前就有遇過ram吃滿，CPU沒有辦法跑出理論GFlops
06/18 23:38, 12F
應該不會是這個問題 就我知道的 我們學長之前開發的程式不太吃ram 所以應該不是ram的問題
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06/18 23:39, , 13F
如果你的計算程式只是一般的單一流程計算程式，那不管
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06/18 23:40, , 14F
少個核：都不會實質增加你的演算速度的。這種程式需要
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06/18 23:41, , 15F
是像 Carry 那種暴力蠻牛（核心時脈與實質核心演算速度
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06/18 23:42, , 16F
）處理器
06/18 23:42, 16F
我們的計算程式有經過平行化處理 但是不能夠跨node (openmp) 我之前自己有測試過 4核心的cpu 和6核心的cpu開了HT比較 執行的時間大概是3:1 也就是6核心cpu速度有快三倍 所以後來買了一台新的雙cpu的電腦 結果跑起來沒有比單顆的快覺得很納悶 買之前有請廠商測試過 他報給我的速度的確有快一倍 可是自己裝好了來用又沒有 要問他們怎麼設定 他們又說要收錢Orz
推
06/19 19:02, , 17F
編譯的時候有正確link嗎？
06/19 19:02, 17F
這個不是很懂
推
06/19 20:37, , 18F
為什麼不把原始碼丟出來呢？不要浪費大家的時間用猜的
06/19 20:37, 18F
抱歉 其實我也算是個電腦白癡 很多地方不是很懂 請問大概是要什麼原始碼呢 丟上cluster跑的程式嗎 實在對這方面不是很熟 十分感謝各位熱心的回答 ※ 編輯: yqwu (1.163.54.181), 06/19/2015 20:56:43
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06/20 00:38, , 19F
既然都平行了怎不用顯卡跑
06/20 00:38, 19F
openmp好像只能用cpu平行化的樣子
推
06/20 02:02, , 20F
先確認你是不是用SMP核心起動OS吧
06/20 02:02, 20F
我來google一下看看這個怎麼確認
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06/21 20:21, , 21F
cat /proc/cpuinfo看看，32bit kernel只到8 cores
06/21 20:21, 21F
是指主機的嗎? ※ 編輯: yqwu (1.171.169.95), 06/21/2015 22:13:03
推
06/21 23:57, , 22F
cat /proc/version 看看有沒有標示SMP啊~
06/21 23:57, 22F
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06/22 08:46, , 23F
原來是這樣看 感謝!! 有標示SMP
06/22 08:46, 23F
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06/22 13:50, , 24F
請問會是主機centos版本太舊的問題嗎 目前5.4
06/22 13:50, 24F
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06/22 16:46, , 25F
跑的時候有確定每個cpu跟cores都有被用到?
06/22 16:46, 25F
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06/22 19:57, , 26F
那 ps 看看執行續有沒有分裂(同程式多個PID)如果沒有
06/22 19:57, 26F
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06/22 19:58, , 27F
程式寫得有問題，如果有，可能要檢查看看是否有互相卡
06/22 19:58, 27F
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06/22 19:59, , 28F
卡關的邏輯判斷式
06/22 19:59, 28F
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06/22 20:22, , 29F
try this
06/22 20:22, 29F
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06/22 20:22, , 30F
export OMP_NUM_THREADS=12
06/22 20:22, 30F
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06/24 03:40, , 31F
主機的啊，如果你沒自己編核心，32bit kernel只認得8cores
06/24 03:40, 31F
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