Re: [求救] PCR 結果一直不理想或沒東西

看板Biotech作者 (六百)時間7年前 (2017/02/17 02:15), 編輯推噓3(307)
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你如果只是要鑑別你的 transgenic mice 身上帶的 transgene 是 A or B 好像不需要 PCR 全長吧? 不是說中間有 400 bp 差異比較大? 那就針對這個區域設計 A specific 跟 B specific 的 primers 啊 每一隻老鼠的 genomic DNA 拿來跑針對 A 以及針對 B 的兩個 PCR 看哪個有跑出來就知道誰是誰 目標 400bp 容易 PCR 而且這樣連 sequencing 都免了 甚至 你可以利用 A 與 B 在那 400 bp 以外的區域高度相似的特性 把 primer 設計成 AB-F(universal), A-R, B-R 三個 並設計成 AB-F + A-R 以及 AB-F + B-R 的產物 size 不同 三個 primer 放一個 PCR 反應跑 看產物大小就完成 genotyping 的目的惹 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 198.137.20.209 ※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Biotech/M.1487268948.A.242.html

02/17 06:18, , 1F
哎呦對嘛 這才叫proper typing
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02/17 08:14, , 2F
(做筆記中) 先謝謝六百!!
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02/17 12:51, , 3F
結果兩個gene實在太相似,這方法行不通,還是感謝!
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02/17 13:04, , 4F
一條 primer 3' 最後那一個 base mismatch 就 PCR 不出了
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02/17 13:04, , 5F
利用這個特性點突變都可以 PCR genotyping
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02/17 13:06, , 6F
雖然實務上這種技巧有時有效有時沒效 case by case
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02/17 13:07, , 7F
另外真的覺得定序才安心的話
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02/17 13:08, , 8F
我還是建議不需要定全長 你挑一段 300bp 上下的去 PCR 就好
02/17 13:08, 8F

02/17 13:58, , 9F
那不如改成用qPCR跑HRM看melting差異.... 咦?
02/17 13:58, 9F

02/17 22:49, , 10F
HRM好方法啊 只是原po不一定有設備
02/17 22:49, 10F
文章代碼(AID): #1OfUnK92 (Biotech)
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