[求救] 請教realtime PCR 定量

看板Biotech作者 (琴心)時間13年前 (2012/05/30 08:58), 編輯推噓5(5推 0噓 9→)
留言14則, 7人參與, 最新討論串1/3 (看更多)
最近在整理 PCR資料的時候想到的問題 如果實驗本身做了三重複 得到三個cDNA sample (a, b, c) 接著PCR對每個sample做三重複，2^-dct method 得到9個資料點 (a1, a2, a3, b1, b2, b3, c1, c2, c3) 請問各位板友，下面三種資料呈現方式哪一個比較正確呢？ 1. 選擇三次實驗中具代表性的一次，如(a1+a2+a3)/3±SD, n=3 2. (a1+a2+a3+..+c1+c2+c3)/9±SE, n=9 3. 取三次實驗各自的平均值，a', 'b, c'，接著以(a'+b'+c')/3±SE, n=3 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 75.180.45.69
推
05/30 14:20, , 1F
若是實驗結果趨勢是一至的,選1
05/30 14:20, 1F
推
05/30 15:18, , 2F
我都用二
05/30 15:18, 2F
→
05/30 15:56, , 3F
如果是上述cDNA定量,用1.是測你的機器的mechanistic error
05/30 15:56, 3F
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05/30 16:01, , 4F
做100次也沒有意義,應該用3.才能比較代表三次exp的error
05/30 16:01, 4F
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05/30 16:03, , 5F
至於其它實驗端看你計算平均值時想要呈現的SD代表什麼意義
05/30 16:03, 5F
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05/30 19:20, , 6F
謝謝三位板友的意見
05/30 19:20, 6F
推
05/31 01:24, , 7F
2是錯的，應該是用3，1的話會有主觀選擇的偏差問題
05/31 01:24, 7F
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05/31 09:53, , 8F
謝謝q板友的說明
05/31 09:53, 8F
推
06/03 01:55, , 9F
3不知會不會把"人為誤差"給忽略了，用2似較能算進人為誤差
06/03 01:55, 9F
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06/03 01:58, , 10F
不過不是很確定，也想要和大家一起討論:)
06/03 01:58, 10F
推
06/12 16:56, , 11F
1才是錯的吧...
06/12 16:56, 11F
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06/12 16:57, , 12F
嚴格來說 3才是最正確的 但也會是SD最大的 所以大部分人
06/12 16:57, 12F
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06/12 16:58, , 13F
可能會從a1 a2 a3的數據當中看看是否有偏差過多的予以刪
06/12 16:58, 13F
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06/12 16:58, , 14F
除 然後再從a' b' c'去統計
06/12 16:58, 14F
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文章代碼(AID): #1FnN2V4H (Biotech)
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