[討論] Gene marker文章討論
小弟最近在研究gene marker
看到很多看似很淺但是確又很重要,讓我似懂非懂的詞
SNP,單一何甘酸多型性,指的是基因序列中,單一何甘酸的變異。
Genotyping,Genotype,
名詞:基因型,指的是基因的序列,型態!甚至是膠片上的片段pattern!
動詞:表示透過各種的實驗方式包含RFLP,RAPD,SNP等方法,了解基因的序列或型態!!
Gene marker:基因分子標誌,指的是一個DNA片段,其位於染色體上,此片段可大可小,
小至SNP(僅有一個NT的差異),甚至是一整個片段的不同;
其功用在於區分細胞個體或是物種。其操作的形式也很多種包含:RFLP,AFLP,
RAPD,SSR,SNP,RAD marker等。
Question 1:以上,我想請教到底這三個怎麼串在一起阿?
Answer:是說:gene marker的方式可以幫助人們了解genotype嗎?
而SNP,或是其他SSR,RFLP,AFLP等,都是幫助genotyping的方法!
我這樣說對嗎?
Question 2:那這樣跟gene mapping有什麼差異??
我也看到了解這些可以幫助了解和疾病(或phenotype)和基因型間的關係
像是GWAS(genome-wide-association-study)
我知道大多數的SNP和及並有關係!但是我們要怎麼知道呢?
High-throughput-screening的技術發達,我們可以很快的解序,
但是我們還是不容易明瞭序列的功能以及其與疾病(表型)!!
Question 3:我這樣說對嗎?我們拿到那麼多的SNP或是marker後,
我們要怎麼作後續的動作?
Question 4:我也有問一位美國的教授,他說現在的解序技術太發達了!
我們可以很快的解序,但是如果要排列序列就很花時間!
請問通常都要做什麼實驗才可以知道其排列的位置?
我知道有透過"recombination rate"估算位置,以及物理性位置(Physical Mapping)
而吉隆米克斯最近推出的next-generation-sequencing,速度快
但基因片段重組,也是一個重要課題。
這位教授建議我:乾脆把需要的物種全部解序,這樣你就可以得到很多資訊了!!
你擁有這些需列資料,你也就有很多的東西可以玩了!!你也可以從中找到你想切入的方向!
以上是我最近閱讀的心得與感想,希望板上的大大先進
給予一些建議或是有用的文章!!幫助我了解更多!!
我有說錯的地方,也請不吝賜教,謝謝!!
--
※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 173.164.68.30
→
07/02 19:19, , 1F
07/02 19:19, 1F
推
07/04 10:37, , 2F
07/04 10:37, 2F
→
07/04 10:37, , 3F
07/04 10:37, 3F
推
07/05 18:12, , 4F
07/05 18:12, 4F
→
07/05 18:13, , 5F
07/05 18:13, 5F
討論串 (同標題文章)
以下文章回應了本文 (最舊先):
完整討論串 (本文為第 1 之 3 篇):