Re: [討論] 關於housekeeping gene

看板Biotech作者 (阿宗)時間13年前 (2011/06/14 23:56), 編輯推噓5(509)
留言14則, 3人參與, 最新討論串2/2 (看更多)
※ 引述《DJHINN (dj)》之銘言: : 最近開始著手操作 real-time PCR : 首先就利用 Actin primer pairs 這個 housekeeping gene 練練手 : 順便計算其 amplication efficiency : 但是我發現 : 僅加水的對照組,卻也跑出相同的產物 : 於是第二次我就將所有東西都換新的 : 包括 1. real time PCR Mix solution : 2. 新的稀釋過的 primer : 3. 新分裝過的水 : 結果第二次結果...水仍然跑出產物 : 而且我將結果拿去跑電泳,水的對照組可以看到清楚的條帶 (同產物) : 因為我們實驗室主要的材料對象是昆蟲,也常常會在冰桶上做研磨的動作 : 昆蟲有時也會飛出.... : 這樣有可能會到處汙染嗎? 由其是 housekeeping gene 這種超靈敏的 gene : 不知道是否有前輩有遇過這樣的問題? : 目前: 我重新將血清瓶洗滌過後,滅了新的 二次水 : 等一下會用一般PCR測試看看到底問題是不是出現在水上面... 會 這會到處污染 通常污染源是來自於放大後的產物,檢體中的量少,通常一般清潔方法就可以去除, 不太會累積 我覺得重點在跑電泳確認這個步驟,跑完後要確實去污 基本上電泳的器具和區域要和實驗完全隔離 且所有接觸到產物的器具使用完後要以1% 漂白水泡30分鐘再沖洗 另外,最好重訂所有藥品 然後確認藥品乾淨再做實驗, 重訂的藥品送來的時候先借別人的冰箱放 確認藥品可用, 先找認識的人借個乾淨的區域 (就是沒有操作類似檢體的地方) 在一天的開始 (就是身上還很乾淨沒有沾到產物的時候) 用PCR REAGENT裡面附的水配製,回溶所有藥品, 接著空跑幾個反應,確認有無產物,沒有的話這批藥品就可以使用 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 118.231.72.155 ※ 編輯: pocession 來自: 118.231.72.155 (06/14 23:57)

06/15 18:08, , 1F
謝謝大大詳盡的回答....這方面我會再多注意
06/15 18:08, 1F

06/16 09:26, , 2F
不知道你們實驗室再處理某些含DNA廢棄物(用過的plate等)
06/16 09:26, 2F

06/16 09:26, , 3F
是用專用的autoclave?還是共用autoclave??
06/16 09:26, 3F

06/16 09:27, , 4F
我也有過類似的經驗,後來才發現autoclave處理後DNA
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06/16 09:28, , 5F
degrade成碎片的大小 通常還是比real-time PCR產物大
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06/16 09:28, , 6F
所以所用用那台autoclave出來的水或容器都會被汙染
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06/16 09:29, , 7F
這方面是有文獻可參閱,不知有無幫助~?
06/16 09:29, 7F

06/16 14:31, , 8F
是共用..autoclave... 不知道可否跟樓上要這篇文獻
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06/16 15:59, , 9F
我看過沒留了,已經畢業很久了...印象中主要的paper是考
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06/16 16:00, , 10F
古相關,化石上殘留DNA要用漂白水才能完全做不出來之類的
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06/16 16:00, , 11F
關於autoclave比較仔細的,是老闆幫我從外國學校的論壇找
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06/16 16:01, , 12F
到相關討論跟解決辦法,用來安慰我不是我的錯的(汗)
06/16 16:01, 12F

06/16 16:34, , 13F
老闆人真好!!
06/16 16:34, 13F

06/17 22:33, , 14F
記得有DNAlookout DNAZap這類贈品..
06/17 22:33, 14F
文章代碼(AID): #1DzuJ7NA (Biotech)
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