[求救] codon usage

看板Biotech作者relaxsleep (火球連發~)時間14年前 (2011/06/09 16:53)推噓2(2推 0噓 5→)

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最近做表現實驗，使用Pichia pastoris當host異源表現fungi基因但是經過誘導後都沒有目標蛋白產生(SDS-PAGE分析) 可是轉殖株又可以在含有抗生素的plate上生長，代表基因應該有送進去?! 懷疑是否為codon usage的問題。序列經codon usage軟體分析(new in version 2.0)後他有兩個選項不是很了解，分別是 relative adaptiveness 與frequency 想請問他代表的意思是?? relative adaptiveness分析後只有6個bp低於20%，7個bp低於10%，且不連續 frequency分析後有好幾個bp是低於20%與10%，比上述分析多，有些有連續為什麼兩種方法結果不同呢?? 是不是這原因造成蛋白質部表現的阿??謝謝~ -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.129.35.102

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Ianthegood

06/09 18:21, , 1^F

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relaxsleep

06/09 23:19, , 2^F

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Ianthegood

06/10 08:31, , 3^F

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