Re: [求救] 限制酶切不好......

看板Biotech作者 (雅)時間15年前 (2010/08/27 00:19), 編輯推噓4(4013)
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※ 引述《nurXiah ()》之銘言: : 最近要把insert換到另一個載體(8kbp) : insert的部分用相同的限制酶已經切好了 跑膠check size也是對的 : 但用同樣的限制酶去切載體(transform到細菌內大量複製,再抽完plasmid)卻一直切不好 : 兩種限制酶試過作用37度 3h,4h,5h 但要切膠回收時跑出來的band都怪怪的 : 有位置明顯不對的 有跑出好幾條band的(照理說應該是兩條) 也有band上方有拖拖的痕跡 會是質體濃度太濃???沒切乾淨?? 沒切成功的質體conformation不同,就會有不同band出現 : 切完膠用kit回收 再跑膠check 出來的都是兩條band(照理來講回收完應該只有一條) 切哪條band呢?確定那條真的是切成功的嗎? : 限制酶各取1ul 也有用指定的buffer plasmid取30ul/100ul和50ul/60ul ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 什麼意思?? 如果你質體用kit抽小量 質體切30ul這麼大量 1ul酵素可能不太有力喔.....說明書上標榜的活性我覺得參考用啦 (不過也要取決於你的濃度啦,因為我質體通常都抽蠻濃的) 因為vector最好確保能夠完全切乾淨 酵素不用太省啦~用多一點(但也有上限喔~忘記不得超過幾%了) : 可是目前做了6,7次 還是做不出來XD : 為了怕有離子干擾 elute都是用滅菌過的二次水 : 但爬文後 發現很多人有做純化的動作 實驗室是沒有這樣做 不知道純化的必要性大不大 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 你不是已經切膠純化了??? : 麻煩經驗豐富的版友給個建議 前面做不出來 後面ligation也不用做了XD -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 122.117.195.131

08/27 01:35, , 1F
might overdigest? which RE? 30/100是指取用量/回溶量嗎
08/27 01:35, 1F

08/27 01:37, , 2F
如果有比較會亂切的RE放太多 切太久有可能會亂切ex EcoRI
08/27 01:37, 2F

08/27 07:44, , 3F
star activity 5% glycerol?
08/27 07:44, 3F

08/28 00:38, , 4F
酵素一般是放在甘油裡的, 切記最後甘油濃度最好小於5%
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08/28 23:58, , 5F
30ul/100ul是指限制酶反應總體積100,plasmid取30下去反應
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沒有測plasmid濃度,只有目測.........
08/29 00:01, 6F

08/29 00:03, , 7F
膠上的兩條band size明顯不同,切膠的時候有切對size
08/29 00:03, 7F

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我是用EcoRI 1ul切4小時,這樣會太久嗎?因為沒有前人的經驗
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08/29 01:11, , 9F
體積都做100ul了,建議提高酵素量,其實如果是我我會用2或3
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4小時我覺得不會太久啦~另外,跟你講一下經驗,之前我有用
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過某家切膠純化kit,明明切一條,但純化後卻有兩條
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切完跑之後大小有很明顯的不同~不過會有濃度的差異
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換另一家kit,就沒有兩條了....但是,那段elute的DNA我是用
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來做DNA probe的,當然也用它做positive control,結果雜合
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完,還真的有弱弱弱弱的band在上面(跑膠沒看到),所以...
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或許有可能是kit的問題吧,其實兩個都是(我猜得啦~~)
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08/29 01:16, , 17F
不然你換套kit看看
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文章代碼(AID): #1CTfGPWU (Biotech)
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