[求救] real time PCR primer設計

看板Biotech作者 (閒來無事)時間15年前 (2010/05/28 13:58), 編輯推噓2(205)
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大家好 我最近要設計兩組realtime primer 但這兩個都是屬於相似度頗高的transcription factor family 我用Beacon disgner設計 primer長度在70~200bp 但真的找不到QQ 我想問一下 為何長度不可超過200 是因為2 step 的program的關係嗎 如果我用3 step 的 是否可以長一些 又 我可以一邊primer在homologous區內 一邊primer在specific區內嗎@@ 又 如果真的不行做realtime 那上述的方法(一邊primer在homologous區內 一邊primer在specific區內) 口以嗎QQ 煩請大家幫幫忙QQ -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.112.52.105

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長度超過兩百的複製效率會不趨近於二
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soga 是因為太長了嗎?
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我突然想問 您不會是想兩組primer能一起跑real-time 且分辨
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還是想要避免A B會有Cross reaction? 若是後者 specific
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primer 3'base變成有差異就好
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其實是我之前有用P出來約300bp的primer組合
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但害怕太長會影響結果,所以有考慮要不要重訂primer XD
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文章代碼(AID): #1B_rkEP0 (Biotech)
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