[求救] 關於小分子蛋白的western blot

看板Biotech作者 (:~)時間15年前 (2009/02/16 22:06), 編輯推噓9(906)
留言15則, 9人參與, 5年前最新討論串1/3 (看更多)
請問一下板上的先進們 我有一個target protein 他分子量只有6kD左右 在跑western的時候總是看不到小分子的蛋白質 因為total protein是從組織粹出來的 所以比較雜 就想說用15%的膠來跑 可是transfer後就都hybrid不到 15kD以下的蛋白都很乾淨 囧 想問是不是transfer的問題 我做的條件是 running是用80V 然後換120V...大概跑個1~2小時 transfer 100mA overnight或250mA 3hr 在4度c冰箱中操作 PVDF membrane是0.2um的孔徑 blocking 5% non-fat milk overnight 4度c wash 1抗 500倍到5000倍都試過了@@ 1抗應該是沒問題 因為我IHC做得出來 wash 2抗 5000倍 wash 壓片... 結果出來...15kD以上的雜band是看得到 可是以下的band就很乾淨..... 應該不是跳海的關係啦@@ 因為marker都還看得到 請問這是出了什麼問題呢? 嗚 我已經快失去信心了 還請各位大哥大姊幫我找到問題的所在>"< -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.112.84.124

02/16 22:28, , 1F
嗯...說不定target protein根本不存在 偶爾會有這種事
02/16 22:28, 1F
不過我做IHC是看得到蛋白的 所以我在懷疑是不是target protein濃度低 所以看不到東西 IHC用Avidin-biotin Complex 所以放大訊號才看到

02/16 22:33, , 2F
如果跑20%????或是 不要跑到底???
02/16 22:33, 2F

02/16 22:33, , 3F
我目前跑的試看15左右的位置 我跑15% 他大概在整片GEL
02/16 22:33, 3F

02/16 22:34, , 4F
的後1/3 但是我的MARKE有看到10...(可我沒有跑的很底)
02/16 22:34, 4F
我跑的位置也差不多 可是我就是看不到啊 嗚

02/16 22:48, , 5F
20%跑的下去嗎? 試試看tricin PAGE 可能比較好
02/16 22:48, 5F
嗯嗯 我來試試tricin好了T_T

02/16 23:04, , 6F
還有 你有放positive control嗎?這樣可以確定技術沒問題
02/16 23:04, 6F
我的positive control有放 不過也是沒看到耶... 會不會是我gel running的時候溫度太高 斷光了啊@@ 跑SDS-PAGE在低溫跑會比較好嗎 嗚哦 我的問題好多>"<

02/16 23:52, , 7F
transfer的時間要縮短 免的trans過頭蛋白跑掉了
02/16 23:52, 7F
嗯嗯 這個我會注意 下次做我縮短時間

02/17 00:31, , 8F
有沒有考慮試試gradient gel?!
02/17 00:31, 8F
有考慮過...不過可能是非不得以才會用 因為不太會做 用買的也不便宜>"<

02/17 10:59, , 9F
用tricin PAGE...我以前跑過6~3KD的 不過要注意配方和濃度
02/17 10:59, 9F

02/17 10:59, , 10F
更正:Tricine-SDS-PAGE system
02/17 10:59, 10F

02/17 11:05, , 11F
running Volt 剛開始慢 之後要用衝的..
02/17 11:05, 11F
嗯嗯 了解 感謝啊^^ 我來試看看tricine如何 再上來跟大家報告XD

02/17 14:35, , 12F
我也覺得是transfer的時間太長 我常用的是400mA 2.5hr
02/17 14:35, 12F
明天我試試把時間縮短 希望可以跑得出來 XD 不過400mA會不會太強啊 因為我沒試過400的^^" ※ 編輯: tsk 來自: 140.112.84.124 (02/17 18:33)

02/18 21:38, , 13F
transfer過頭 電流調小或時間縮短
02/18 21:38, 13F

11/11 01:17, , 14F
有沒有考慮試試grad https://muxiv.com
11/11 01:17, 14F

01/03 16:51, 5年前 , 15F
我目前跑的試看15左右 https://noxiv.com
01/03 16:51, 15F
文章代碼(AID): #19cNBOtT (Biotech)
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