[求救] TRIZOL 抽 Plant Total RNA 量太低

看板Biotech作者 (我一個人住)時間15年前 (2009/01/28 13:43), 編輯推噓5(507)
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發問時請注意,若是要問實驗相關的問題,請將實驗的步驟、所用的條件大致列出 以方便板友幫您追蹤問題 ----請將上列注意事項以 ctrl + k 刪除後開始編輯文章---- 1. 秤重 0.1 g (頂多增加到 1.5 g). 放入Tube中. 再放入液態氮中 2. 自液態氮中取出 Tube,磨碎後先加300 μl TRIZOL vortex, 再加700 μl TRIZOL # 我也用過研缽磨成粉後,把粉末取出來秤重,再加TRIZOL, 但濃度還是一樣低,不知道是不是動作不夠快 3. RT/15 min, 12,000 x 15 min x 4℃ 4. 加 200 μl Chloroform. shake 15-30 s, 12,000 g x 15 min x 4℃ 5. 加 0.5 ml isopropanel, RT/10 min 6. 12,000 g x 10 min x 4℃ 留pellet. 7. 加 1 mL 75% EtOH Wash. (可vortex讓pellet漂浮) 8. 7,500 g x 5 min x 4℃, 抽掉 EtOH 9. Air – Dry/10 min 10. 加 20 μl ddH2O (50℃), 回溶 20 min, 測 OD值 11. 取 10 μg Total RNA (最少) + 10X Buffer (TURBO) + DNase 1 μl + ddH2O, Total Volume 25 μl, 37℃ / 30 min 12. 加 2.5 μl inactivation buffer (TURBO), RT/2 min 13. 10,000 g x 2 min x 4℃, 取上層到 new Tube 中, 測 OD值 14. 合成 cDNA (因為濃度太低,所以沒有往下做) 感謝大家耐心看完,如果有任何建議,麻煩也寫在版上或寫信給我 這個步驟停了好久,有點糟糕 也祝大家 新年快樂 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.112.154.103

01/28 23:03, , 1F
RNA量太低多是因為 原本量就低(植物?部位?年紀?)
01/28 23:03, 1F

01/28 23:03, , 2F
或是degrated了(第一步驟感覺會回潤 過程RNase污染?)
01/28 23:03, 2F

01/29 18:30, , 3F
濃度高低跟是否degradation無關係吧...測OD是測嘌呤跟嘧啶
01/29 18:30, 3F

01/29 18:30, , 4F
的共振結構..
01/29 18:30, 4F

01/29 18:32, , 5F
我沒抽過植物的RNA但我猜會不會是因為細胞壁破壞效率不高?
01/29 18:32, 5F

01/29 19:59, , 6F
做RT的酵素我記得敏感度超大,隨便做都做的出來@@a
01/29 19:59, 6F

01/30 13:16, , 7F
植物有些部位不容易抽取 如果多醣太多會干擾實驗
01/30 13:16, 7F

01/30 13:26, , 8F
你們實驗室有人用這個方法跟你抽一樣的sample出來過嗎!?如
01/30 13:26, 8F

01/30 13:27, , 9F
果有可能是手法上問題~ 如果只有你試~而且一直存在相同問題
01/30 13:27, 9F

01/30 13:28, , 10F
不如換個protocol去做~你可以試試看CTAB~
01/30 13:28, 10F

11/11 01:15, , 11F
你們實驗室有人用這個方 https://daxiv.com
11/11 01:15, 11F

01/03 16:50, 5年前 , 12F
我沒抽過植物的RNA但 https://noxiv.com
01/03 16:50, 12F
文章代碼(AID): #19V_1vaY (Biotech)
文章代碼(AID): #19V_1vaY (Biotech)