Re: <求救>lipofectamine 效率

看板Biotech作者 (提那豬)時間17年前 (2008/10/07 11:44), 編輯推噓1(106)
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※ 引述《nidus (咕嘰)》之銘言: : ※ [本文轉錄自 Biology 看板] : 作者: nidus (咕嘰) 看板: Biology : 標題: <求救>lipofectamine 效率 : 時間: Sun Oct 5 22:49:17 2008 : 請問有人用過嗎?? : 我做了好幾次效率低到看不到想要表現的protein : 我的步驟如下: : genaid抽plasmid 再以酒精沈澱進一步純化 我之前是不需要用到酒精鹽沈澱,抽完的產物基本上就ok : 使用細胞為hela (我是用RD細胞) : transfect 前一天在六公分盤種9X10五次方細胞 : 第二天取500λserum free DMEM 與 3μg plasmid混和 : 20λlipofectamine與500λserum free DMEM混和 等五分鐘 : 將上述兩溶液混和 等20分鐘 : 將混合液倒入昨天seeding好的HeLa cell 六公分盤中 : HeLa cell 六公分盤會先以PBS wash兩次 以將serum洗掉 : 六小時候再將medium置換成有serum的DMEM : 24小時候收細胞 western檢測 : ------------------------------------------------------------------- : plasmid有提高至8μg 結果還是一樣 : plasmid也有digest後跑膠 位置也對 請問有確認過sequence嗎? 確認您的start codon跟fusion protein跟您的tag有in frame? : 只不過我欲表現的protein 並不是一個完整的protein : 完整序列有276aa 而我只有取1~120 : 請問有沒有可能是無法folding而被進一步degrate掉?? 我覺得有可能,因為我遇過類似的狀況 某protein的一系列deletional mutation 就有一兩個是幾乎不表現(band很弱) 當時有學長建議我用MG132之類的protein degradation inhibitor 後來真的有增加產量 (但也沒有正常表現的多) 若您實驗室有現成的protease inhibitor -->抱歉我是指"proteasome inhibitor" 也許可以試試看 或者如果是怕transfection 效率不好 也許下次可以做一個postive control~ 同時多做一組已確定可表現的construct 這樣也可以幫忙釐清是否transfection效率問題 不確定是否能幫到您~ 以上 : 以上希望有大大相助 任何建議都好 : 謝謝 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.128.140.89 ※ 編輯: tinapig 來自: 140.128.140.89 (10/07 11:50)

10/08 17:13, , 1F
其實我每次做都會加protease inhibitor(cocktial)....
10/08 17:13, 1F
抱歉我是指proteasome inhibitor 一類的藥(原文訂正處)

10/08 17:15, , 2F
我也有一組positive Control 也都有大量表現出來....
10/08 17:15, 2F

10/08 17:16, , 3F
因為目前我使用的這幾組deletional protein以前的學姐有表現
10/08 17:16, 3F

10/08 17:17, , 4F
出來,所以我猜應該也都有in frame
10/08 17:17, 4F

10/08 17:20, , 5F
找不到原因下...目前我是換一個cell line(HEK 293)來做做看
10/08 17:20, 5F

10/08 17:20, , 6F
如果在做不出來...應該會sequencing那些plasmid吧>"<
10/08 17:20, 6F
恩嗯,也許sequencing會是最快最直接的方法 (可以先思考是否有可能菌的保存有沒有可能污染?拿錯?)

10/08 17:21, , 7F
謝謝您熱心的建議^^
10/08 17:21, 7F
不客氣~希望您實驗順利囉^^ ※ 編輯: tinapig 來自: 140.128.140.89 (10/08 17:23)
文章代碼(AID): #18wjiVho (Biotech)
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