Re: [求救] 抽RNA定量問題

看板Biotech作者 (Isopotenal)時間18年前 (2008/01/29 02:33), 編輯推噓4(406)
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※ 引述《qkenny (想變白的巧克力)》之銘言: : 請問一下 : 一般細胞是抽完RNA然後定幾個microgram下去做RT? 一般做RT都是買kit來做 kit上面都有很詳細的說明 您看上面一定有講說跑RT您所需要加入的濃度是多少 : 還有若是有感染RNA病毒的細胞 : 在測吸光值的時候 RNA量會特別高 : 那定RNA總量下去跑 細胞被病毒infect以後分兩種途徑 一種是病毒會拼命的讓細胞製造病毒 這樣細胞的RNA的濃度當然會上升 不跑RT只做定量的話 只能證明說妳的病毒可能真的有infect細胞 : 例如:定2 microgram total RNA 若測吸光值為6000ng/ microL : 一般細胞沒感染的話在1000多 : 那不是細胞的RNA相對變少 : 是不是就不能用actin去定量? : 那有什麼定量的方法? : 謝謝 actin是housekeeping geen 基本上不管病毒有沒有infect應該都是固定量 所以才會常被用來做interal control 當然可能有少數會影響actin的病毒 如果您的病毒前人已經有做過 可以自己去查一下reference 如果沒人做過 用RT測試一下就知道您的actin有沒有被影響嚕!! 定量的話我都是用spectrophotometer 我是沒用到actin 用到actin通常是跑膠才會用到 如果純粹只是要定total RNA只需要用spectrophotometer 就行啦!! -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 220.139.74.41

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不同的細胞種類用不同的internal control
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例如肝臟再生時常用是beta2 microtubulin 而不能用其他的
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所以要選一個大家認可表現量不會改變的 比較適合
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謝謝 我是想說若有細胞株對病毒感受性不同 要怎樣做出來的
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圖 PCR後 可以看到actin的band量相同 而病毒的band量不同
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所以想問抽RNA 後要怎樣定量做cDNA 跑PCR才有那樣的結果
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要不要試試看不要管actin,DNase處理後的RNA拿去測吸光值
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再跑膠確定濃度真的調整成一致 然後再轉cDNA
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建議不用actin的原因是說不定病毒感染會改變actin表現量
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而且細胞株不同 actin的表現量應該會有所差異
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