Re: [問題] 關於NCBI的BLASTn之後的一些資料/數據
※ 引述《YuDavid.bbs@ptt.cc (討厭失眠)》之銘言：
> 各位高手大家好
> 我在做"細菌菌種鑑定"的實驗
> 主要步驟是提取total DNA 然後PCR夾出16S rRNA gene然後去BLAST 鑑定到"屬"或"種"
> 我將定序出來的結果到BLASTn去輸入
> 出來了一些資料包括max score, total score, query coverage, E value, max ident..
> 等等
> 請問分別都代表什麼意思呢
> "同源性最高的"應該是哪個數值最大或最小呢?
> 我原本以為是max ident百分之百的 就是我要的結果
> 可是那個百分之百的score佑是最低的@@
> 抱歉我們老師也不太會
> 所以我只能上來問問各位高手
> 請大家幫忙 感恩
> ~
> ~
你的老師不是太混就是懶得理你
max identity 100%就是你要的
但是如果你輸入序列太短
最好也看一下 E值 越接近0越是你要的
--
※ Origin: 生命科學 BBS <bbs.life.nthu.edu.tw>
◆ From: 61-59-139-151.adsl.static.seed.net.tw
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