[問題] 關於NCBI的BLASTn之後的一些資料/數據

看板Biotech作者 (討厭失眠)時間18年前 (2007/05/28 01:15), 編輯推噓1(1推 0噓 1→)
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各位高手大家好 我在做"細菌菌種鑑定"的實驗 主要步驟是提取total DNA 然後PCR夾出16S rRNA gene然後去BLAST 鑑定到"屬"或"種" 我將定序出來的結果到BLASTn去輸入 出來了一些資料包括max score, total score, query coverage, E value, max ident.. 等等 請問分別都代表什麼意思呢 "同源性最高的"應該是哪個數值最大或最小呢? 我原本以為是max ident百分之百的 就是我要的結果 可是那個百分之百的score佑是最低的@@ 抱歉我們老師也不太會 所以我只能上來問問各位高手 請大家幫忙 感恩 ~ ~ -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 123.112.22.252
推
05/28 01:41, , 1F
hit太短的話,即使是ident 100%, score也不會太高
05/28 01:41, 1F
→
05/28 01:42, , 2F
要簡單判斷可以看score(越高越好)或E-value(越低越好)
05/28 01:42, 2F
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文章代碼(AID): #16MRoPZb (Biotech)
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