Re: [問題] DNA定序之後的問題

看板Biotech作者 (...)時間17年前 (2006/11/03 15:00), 編輯推噓0(000)
留言0則, 0人參與, 最新討論串2/5 (看更多)
※ 引述《lovepig414 (pig)》之銘言: : 各位大大 : 小弟以本實驗室的細胞株做了RT-PCR後,之後再做clone完後,送生技公司做定序, : 定序完成後,上了NCBI做序列比對,發現自己做的定序和資料庫上的定序相似 : 度高達98%,我想應該是很高吧,所以推測此細胞應該是有此基因,然而,我的 : 老闆卻問我了一個問題,就是為什麼相似度不是100%?要我做回覆! : 我自己想的結論是: : 1.也許是機器的問題,本身就有錯誤率!(但是機器做出錯誤的 : 機率是很低的!) : 2.也許是基因上本身就有一點不一樣,但是轉譯出的protein : ,可能會是相同的!(這個可以做胺基酸比對得知。) : 再來我就不太知道為什麼了,自己也上網站找尋了一下,但是真的找不太到相 : 關的資料,不知道板上的大大們,有沒有人可以幫幫我啊!再過幾天就要meeting, : 可是我卻如此的不知所以然,救救我吧! 感恩阿! 可以去看看定序序列的raw data,也就是peak,通常定序的長度差不多都在1Kb或是 少於,而且剛開始或是最後序列無法判定的情形是常見的,建議您親自看看peak profile。 另外可能您的基因有mutation也說不定阿! 參考一下... -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 211.76.175.139
文章代碼(AID): #15IkaCEP (Biotech)
討論串 (同標題文章)
文章代碼(AID): #15IkaCEP (Biotech)