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討論串[問題] 基因定序
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#1
[問題] 基因定序
推噓0(0推 0噓 0→)留言0則，0人參與, 最新作者Arton0306 (科學主義)時間16年前 (2007/12/16 18:41), 編輯資訊
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【問題】：. 基因定序的方式. http://www.cbcb.umd.edu/research/assembly_primer.shtml. 我從這個知道有很多方式，但大都是小片段組成原來序列的問題. 那那個小片段是如何知道的？. 這小片段是不是無法100%確定？錯誤率很高嗎??. 【問題起因】：
(還有88個字)
#2
Re: [問題] 基因定序
推噓0(0推 0噓 0→)留言0則，0人參與, 最新作者boblu.時間16年前 (2007/12/17 02:01), 編輯資訊
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顯然您不是生物本行. DNA 定序的原理建議找本分子生物學的教科書來看. 找中譯本就好. 基本上是化學方法. 實作上可能產生誤差的原因很多啦. 品質好的結果 錯誤大約是數千分之一吧. 聽起來不多 但是考慮總體來說需要定序的量 這樣錯誤率就還是滿高的. 至於說 "直接觀察" 的方法 是有人在開發不過目
(還有485個字)
#3
Re: [問題] 基因定序
推噓0(0推 0噓 0→)留言0則，0人參與, 最新作者yucmbuu (yucmbuu)時間16年前 (2007/12/18 23:57), 編輯資訊
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利用核酸定序儀定序. 端看序列分析的次數, 因為使用酵素放大訊號, 酵素本身會有正確率的問題,. 錯誤機率大約每一萬個到十萬個可能會錯一個.. 錯誤的可能性在於基因體中常含有重複片段存在, 一旦重複片段位於各定序. 片段的兩端或重複片段的長度超過所定序片段的長度, 常會造成前後順序錯. 誤, 另外,
(還有78個字)
#4
Re: [問題] 基因定序
推噓0(0推 0噓 0→)留言0則，0人參與, 最新作者nightcatman (夜貓)時間16年前 (2007/12/19 18:17), 編輯資訊
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這段稍微補完一下. 實務上基因體定序就是由這樣的方法得到90%以上的序列. 只是由於上述的理由,會有個再也上不去的極限. 之後就得手動試運氣補上這些gap. 通常使用的方法是從cDNA library開始慢慢試... Orz. 所以最花時間的就是這個finalise的階段. 如果gap不多的話,有些
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