Re: [程式] 在R裡面用多組資料作線性迴歸
※ 引述《swwf (十字路口)》之銘言:
: ------------------------------------------------------------------------
: [軟體程式類別]:R
: [程式問題]: 資料處理、迴歸
: [軟體熟悉度]:
: 低(1~3個月)
: [問題敘述]:
:
: 是這樣,我有多組數據需要跑線性迴歸,y~ ax+b
: 如果只是單純跑一組的話我還會弄,但如果是很多分組分層的話就不知道怎麼寫迴圈
: 原始數據是X(時間),和Y(存活比率)作簡單直線迴歸,
: 現在如果我數據有多項不同的處理,整理結果如下樣式
: 處理A 處理B 處理C 重複 時間 存活比率
: 7個層級 2個層級 6個 4個 X1~Xn Y1~ Yn
: 要注意的是,每個組合的時間n是不一樣的觀察數量,有的組合觀察數少(早早全死光),
: 有的高(等很久才死完)
: 現在想要跑這7*2*6*4個直線迴歸,把作迴歸得來的值給輸出,
: 並把這些直線迴歸作圖,請問我的迴圈程式要怎麼寫?
: 搞不清楚要用apply還是tapply...
: 請詳盡敘述遭遇到的問題,可能的話,分點敘述你要處理的流程
: [程式範例]:
: 雖然張貼程式很可怕,但基本上有些程式還是要張貼才能解決
: for (i in treat1)
: {for (j in treat2)
: {for (k in treat3)
: {for (l in rep)
: {lm.reg=lm(x~y)
: }
: }
: }
: }
: summary[i,j,k,l](lm.reg)
: plot[i,j,k,l](x,y)
: -----------------------------------------------------------------------------
: 不好意思,我是R和寫程式的新手,真的不太知道要怎麼樣跑這種迴圈,另外想要一頁
: 多圖把結果的圖都畫一下,想請教各位大大指導我該如何寫這迴圈,謝謝。
: 打擾各位不好意思 >_<
問題實在問的很不清楚,我就按照我假設你在想的做吧
你想要做7*2*4*6個迴歸,而輸出的項目是每個迴歸的"斜率"及"標準誤"
如果你還想輸出更多東西就自己寫在迴圈內吧
Output=matrix(NA,nrow=7*2*4*6,ncol=6)
data$treat1=factor(data$treat1)
data$treat2=factor(data$treat2)
data$treat3=factor(data$treat3)
data$rep=factor(data$rep)
for (i in 1:length(levels(treat1))) {
for (j in 1:length(levels(treat2))) {
for (k in 1:length(levels(treat3))) {
for (l in 1:length(levels(rep))) {
dataset=data[data$treat1==levels(treat1)[i]&data$treat2==levels(treat2)[j]&data
$treat3==levels(treat3)[k]&data$rep==levels(rep)[l],]
n=2*4*6*(i-1)+4*6*(j-1)+6*(k-1)+l
Output[n,1]=levels(treat1)[i]
Output[n,2]=levels(treat2)[j]
Output[n,3]=levels(treat3)[k]
Output[n,4]=levels(rep)[l]
if (sum(dataset$x)==0) {
Output[n,5]=NA
Output[n,6]=NA
}
else {
Output[n,5]=lm(y~x,data=dataset)$coefficients[2]
Output[n,6]=summary(lm(y~x,data=dataset))$coefficients[2,2]
}
}
}
}
}
colnames(Output)=c("treat1","treat2","treat3","rep","coefficients","se")
最後Output這項物件就有你要的結果
共有7*2*4*6列
第一行是treat1
第二行是treat2
第三行是treat3
第四行是rep
第五行是符合前4項條件的資料的斜率
第六行是符合前4項條件的資料的斜率的標準誤
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