Re: [問題] 讀入字串之後搜索並列印該行
※ 引述《Arton0306 (Ar藤)》之銘言:
: ※ 引述《consley (je ne sais quoi)》之銘言:
: : 各位版大好 小弟最近剛開始學python 是透過putty連上unix
: : 是有關基因序列的
: : 我用raw_input讀入一字串
: : 然後希望在字串中找到'>'並列印出該行文字(head)
: : 然後再抓取下一行的基因序列進行後續處理
: : 我的問題是要用何種語法找到'>'並列印出該整行?
: : 然後如何再把下一行抓到另一個字串陣列裡進行後續處理?
: : 或是各位高手有更好的處理方法 也請不吝指教
: : Example input:
: : AGGTGGCCAAAACTCGTCTT
: : Example output:
: : length:
: : G+C:
: : Entropy:
: 基因庫抓出來的 ">"應該是固定當做一筆資料一個
: 不知你為什麼要用raw_input
: 要用這個就用alist.index找 或是if ">" in astring
我也是初學者
我之前寫過類似的東西
我覺得一定有更好的方法
我把input 存在 list 裡面用
alist = file("input.txt", "r").readlines()
start_number = alist.index('>')
然後下一行就是 seq = alist[start_number+1]
拋磚引玉一下
請高手提供更聰明的方法
: 只是>應該都在第一位吧 而且一筆資料就只有一個>
: 我以前遇到的是這樣
: 我是直接讀檔 f.read().split(">")
: 這樣就把每一筆基因資料拆開了
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03/21 13:34, , 1F
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