Re: [請問] PI值
side chain上的pkR也要考慮。
tripeptide，以Ala-Glu-Lys作舉例：
+ -
H3N─Ala─Glu─Lys-COO
│ - │+
COO NH3
+
整個tripeptide可以解離的 H 有4個，因此有4個pKa值。
在表中列出：
+
pk1(COOH) pk2(NH3) pkR(R group)
Ala 2.34 9.69
Glu 2.19 9.67 4.25
Lys 2.18 8.95 10.53
分別是Ala的pk2(9.69)、Glu的pkR(4.25)、Lys的pk1(2.18)及pkR(10.53)，
因此由pH值高低由低到高排列分別為：
Lys的pk1(2.18)、Glu的pkR(4.25)、Ala的pk2(9.69)、Lys的pkR(10.53)。
pH<2.18時tripeptide的net charge=+2
+
H3N─Ala─Glu─Lys-COOH
│ │+
COOH NH3
2.18<pH<4.25時tripeptide的net charge=+1
+ -
H3N─Ala─Glu─Lys-COO
│ │+
COOH NH3
4.25<pH<9.69時tripeptide的net charge=0
+ -
H3N─Ala─Glu─Lys-COO
│ - │+
COO NH3
9.69<pH<10.53時tripeptide的net charge=-1
-
H2N─Ala─Glu─Lys-COO
│ - │+
COO NH3
pH大於等於10.53時tripeptide的net charge=-2
-
H2N─Ala─Glu─Lys-COO
│ - │
COO NH2
貼了那麼多，發現我們要找的pI值是在net charge=0時，
因此pI=1/2[pkR(4.25) of Glu) + pk2(9.69) of Ala]
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※ 引述《laevulose (果果)》之銘言：
: 如果是tripeptide應該要怎麼算呢
: 是三個的Pka加起來除以三嗎?
: 還是其中兩個加起來平均 再跟另一個平均?
: 還是只取其中兩個平均呢?
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11/11 23:31, , 1F
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