Re: [問題]有沒有人會看這個圖啊

看板CSMU-LS89作者sGoat (無三小羚羊)時間19年前 (2005/08/23 23:01)推噓5(5推 0噓 20→)

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※ 引述《goodman1 (來徵女友好了)》之銘言： : http://p2.p.pixnet.net/albums/userpics/2/3/17323/112477805326.jpg

: 1.這種圖是叫做「genotyping」還是「haplotyping」啊？＠＠？這種圖其實指出了套數(copy number)以及遺傳性的資料... 你把每個peak當成是跑膠的band而波峰高度當成是band的濃度... 再把父母跟病人的圖想像是一張由左跑到右的電泳圖... 於是這就像極了一張RFLP的圖... 利用RFLP來鑑定親源的原理不用我多說了吧... 至於在這張圖裡出現的多個波峰跟波峰的高度所代表的意義... 如果這種圖的看法跟流式細胞儀(flow cytometry)的方式要是一樣的話... 每個完整的peak圖(例如在父系的D11S4046的四個peak)下方所圍起來的面積... 是代表在這整個genome中擁有這個allele的基因... 簡單來說若是四個peak的高度加起來算是100%的話... 那麼每個peak的高度就代表擁有這種套數的細胞在整個帶有此種allele的細胞中所佔比例但是有的帶有單套有的帶有雙套要怎樣分別... 以flow cytometry的例子來說... 當細胞中的allele套數增加時,在數據中的peak會向後位移... 通常每個相鄰的peak會以倍數成長... 以在父系的D11S4046的四個peak為例子... 當第一個peak是單套的細胞時,下一個peak代表的是雙套細胞的量,再下一個是四套的... 再下一個是十六套的以此類推(這邊不太確認,若有錯請指正) 而每個peak的相對高度代表細胞在整個帶有此allele的細胞群中所佔的比例... ↑ (其實是面積) 例如有abc三個連續peak 分別有8,12,4的數量,a在這其中佔有8/24的數量... b佔有12/24,c佔有4/24...而a可能是單套,b是雙套,c是四套... 不過這是以flow cytometry作為資料分析的情形... 你參考看看... : 2.要怎麼看？ : 她說這個編號SR90的病人跟她的父母 : 用三個STR marker去看在染色體11p15位置上的duplication : 相較之下，這個病人的DNA在locus D11S4046的母系allele 196.64上 : D11S1760 88.95 : D11S1984 169.88 : 有增加的copy number : 就這兩個問題吧，我常常看到這種圖，可是都看不懂不會看 ><" : 有沒有人會的麻煩教一下吧（跪） -- -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.120.130.14

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