[情報] 普生作業...
抱歉讓大家等這麼久,我看了好久問了好多人還是有地方不太懂,希望不會錯,
老師的講義真的好難懂...
p.41
連上這個網址:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/e-pcr/
然後點選圖片上的"Forward e-PCR",然後在那個很大的欄位裡輸入"AC012557"點
選"Submit Query",然後按Ctrl+F把所有有Homo sapiens的項目找出來就OK了。
p.57
簡單來說,就是一個BAC clone有1.5x10^5那麼長,人的有3.0x10^9那麼長
然後BAC和BAC之間重疊的部分有3x10^4那麼長,要算需要幾個BAC才能cover
整個human genome?
(1.5x10^5 - 3x10^4) x N + 1.5x10^5 = 3x10^9
N + 1 = 24999.75 所以 N = 25000
答案僅供參考
p.80
簡單來說就是用p78和p.79兩頁的網站,根據步驟然後就可以有答案了...
http://www.ensembl.org/biomart/martview/<----這是網址
步驟:
1.按下上面紅色的"New",確認Dataset是Homo sapiens genes,然後右方的Database
是Ensembl 43。
2.點一下Homo.....下方的"Attributes"右方勾選"Sequences",然後點一下下方
"SEQUENCES"左邊的"+"勾選"Coding sequence"。
3.回到左方點一下"Filters",右方點"REGION"旁的"+","Chromosome"打勾選擇"1"
"band"打勾,然後...
這邊比較有問題的是在輸入band的start和end的地方,根據題目給的SCA19的基因
是落在一號染色體的p21-q23,但是我發現不輸入小數點他是算不出來的(輸入0
也一樣),如果要包括整個p21和q23的話,應該就是從p21.3到q23.3(p21和q23只
到.3)關於小數點的問題請參考:
http://www.bhp-gc.tw/front/bin/ptdetail.phtml?Part=netclass9501-NO3&PreView=1
4.輸入完band後點上面紅色的"Count",然後Dataset後面跑出的數字就是答案了...
我點出來的結果是 865 / 31,452 Genes,答案僅供參考XD
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這三個作業都是用PowerPoint做的,做完一樣寄到yfliu@csmu.edu.tw,信的title要註明
班級,姓名,學號,交的時間是禮拜四之前。
然後關於最後一個作業,小數點的部分我還不是很肯定,今天我去找老師的時候,他的門
著但是人已經消失了...如果錯了麻煩提醒一下,感謝!
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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 140.128.142.247
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