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討論串[求救]primer design之我是新手
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#7
Re: [求救]primer design之我是新手
推噓1(1推 0噓 5→)留言6則，0人參與, 最新作者reinherd (揚威利信徒萊因哈特)時間16年前 (2010/02/26 02:34), 編輯資訊
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我最近也在design qPCR primer. 正在做E-cadherin的 因為我目前手上的都不太行. 靈敏度都不夠高. 我遇到的問題是 因為E-cadherin 是一個有接近900 amino acid的大蛋白質. 光是exon就有17個 我目前的想法是以最接近3'end的兩個exon來設計p
(還有113個字)
#6
Re: [求救]primer design之我是新手
推噓1(1推 0噓 1→)留言2則，0人參與, 最新作者childchen ( )時間16年前 (2010/02/25 17:34), 編輯資訊
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因為genomic DNA含有intron. 而cDNA則沒有. 設計跨junation的primer. 理論上就不會夾到genomic DNA. --. ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc). ◆ From: 140.112.121.239.
#5
Re: [求救]primer design之我是新手
推噓0(0推 0噓 2→)留言2則，0人參與, 最新作者crystal0602 (好黑的心情)時間16年前 (2010/02/25 15:23), 編輯資訊
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恕刪. 想請問大家.....何謂跨過junation, 為何這樣可以避免genome DNA的干擾?. 我自己設計primr是都會設計在不同exon上,但不太明白為什麼這樣就可以避免. genomic DNA的干擾?. 請問有人可以解惑嗎?? 謝謝. --. ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc
#4
Re: [求救]primer design之我是新手已刪文
推噓1(1推 0噓 1→)留言2則，0人參與, 最新作者jazzdevil (Hola)時間17年前 (2008/08/04 22:34), 編輯資訊
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我是用ABI primer express 3.0做設計. 目前我也是覺得照條件跑出來的沒這麼滿意. 後來也有把amplicon調高到200-250 bp. 其它的大多照大家建議的方式做微調整. 可是看來看去都覺得有一好沒兩好. 假設 Forward裡面 cross dimers GC鍵結一條;AT
(還有66個字)
#3
Re: [求救]primer design之我是新手
推噓2(2推 0噓 1→)留言3則，0人參與, 最新作者hajimels (阿一)時間18年前 (2008/02/11 00:38), 編輯資訊
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Try this website:. http://medgen.ugent.be/rtprimerdb/. You can search the gene symbol which you wanna design a primer for Q-PCR.. Good luck~. --. ★ミ ζ
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