Re: [討論] 關於RNA-seq

看板Biotech作者lelojack (莉羅夾克)時間7年前 (2016/10/19 21:52)推噓2(2推 0噓 2→)

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※ 引述《liberty5556 (赫拉克羅斯)》之銘言： : 若從抗病品種及不抗病品種RNA-seq數據中，比較得知在抗病品種表現量高的基因。 : 請問要如何回頭做genetic mapping? : 定位這些基因在染色體上的位置呢？在沒有Genome的狀況下是無法做mapping的喔我用有Genome情況下回答假設我要找香蕉的FLS2序列在哪個chromosome上 http://imgur.com/a/1v7qa 請到ensmebl上找blast工具 http://plants.ensembl.org/Musa_acuminata/Tools/Blast?db=core 結果很漂亮的座落在chromosome 6上 http://imgur.com/a/n8lQy 如果沒有參考序列就請私訊我吧我或許我有其他辦法 J -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 122.146.39.201 ※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Biotech/M.1476885126.A.D8F.html

推

liuse

10/20 09:18, , 1^F

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Ianthegood

10/20 16:56, , 2^F

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lelojack

10/20 21:25, , 3^F

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