[閒聊] Genome editing - CRISPR/Cas9
大家好,標題用閒聊是想聽聽大家的意見。
如果不合適的話請告訴我,我會修改 m(_ _)m
我的實驗室最近想要開始使用 CRISPRC/Cas9,
除了從 addgene 買了相對應的 vector,
為了快速地確認這個技術在實驗室是成功的,
我們決定先把有 stable eGFP transfect 的細胞裡的 eGFP 做 deletion。
根據 gRNA 設計的原理,
最後挑了四個 gRNA
gRNA1 gRNA2
5'-nnnnnnnnnn 我是 eGFP nnnnnnnnnnn-3'
3'-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-5'
gRNA3 gRNA4
gRNA1,2 是根據 (+) strain 設計的
gRNA3,4 是根據 (-) strain 設計的
為了確定可以把 eGFP 去掉,
除了一定要的 Cas9 以外,
打算做 gRNA1+gRNA2
gRNA1+gRNA4
gRNA3+gRNA2
gRNA3+gRNA4 四組 co-transfection
然後再看看哪一組都不亮了、並配合 FACS 跟 genomic DNA PCR 確定真的成功了。
設計這四組 co-transfection,合理嗎?
還是我們想太多了?
雖然很可能試了才知道怎麼會成功,
不知道有沒有人可以分享一些經驗^^
謝謝 m(_ _)m
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