[閒聊] TALENs與CRISPR

看板Biotech作者 (Blut_Kreuz)時間10年前 (2014/03/19 11:46), 編輯推噓7(7推 0噓 32→)
留言39則, 6人參與, 最新討論串1/2 (看更多)
拍謝 這是小弟第一次發文 如果排版不好還請見諒 不知道版上有沒有人有對TALENs或者是CRISPR有所涉略? 最近我老闆要我去找相關PAPER 也看了幾篇有所理解 似乎是出錯率低又精準的技術 不知道各位版友怎麼看? -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.128.17.107
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可否再說明一下你的想法，以便拋磚引玉，幫助討論
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我也想找這方面的資訊，雖然TALEN有kit，
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不過用的人好像不多
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有用過的先進，可以分享一下心得嗎?
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目前個人的理解是，雖然宣稱是knockout基因，
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不過好像有需要特別的序列(結構?)
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目前我是TALENs的paper看得比較多, CRISPR則
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僅在一篇review讀過,
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Addgene(聯奇)有出一套TALEN的KIT，不過成大沒人用過
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也不知道效果好不好
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而整個TALENs的構成,都是兩兩一組,分別定位在指定的DNA
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雙股兩側, 可以這麼辦到是因為TALENs的結構,在一個單元
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體中, 重要的部分有二, 一是C端的FokI及整組結構中間的
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DNA binding domain,則由約15個胺基酸的重複序列構成
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而該重複序列則由約34個胺基酸構成,但其中重要的是第12
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及13個,這邊決定了該段所結合的核苷酸對象
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結構大概是這樣吧...話說要怎麼用圖片上來?
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至於new大你說的那個KIT我也沒有用過QAQ
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推
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現在CRISPR正火,因為你只需要的是guide sequence
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specific binding to DNA element, 不像TALEN需要
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protein DNA binding (而一些papers claim CRISPR
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offtarget effect 相對小,Cas9相關paper也幾乎是一個
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月就可能出好幾篇,應用也不再局限於 gene knockout
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推
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http://ppt.cc/Y-nQ 你可以看一下這篇討論 ZFN,TALEN
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還有CRISPR的比較,http://ppt.cc/~HJc 這篇則是較新的
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CRISPR應用的整理
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推
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力鈞的教學 算上的蠻清楚的 可以去聽看看
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M大:我先看下應用那篇, D大:力均是指?拍謝我接住這個領域
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沒多久還望海涵諸多不懂.
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接觸
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推
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感謝m大資訊，我也來看看
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推
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力鈞現在在促銷CRISPR，舉辦多場workshop，親自參加操
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作ㄧ遍，應該會很有收穫吧! 反正是免費的~相信workshop
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中也會比較幾種傳統的製作方式跟CRISPR的優缺點
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推
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剛去看了一下poster,發現張鋒lab那套Cas9 knockout
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creen library未來應用性很大,有興趣可看
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推
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下禮拜成大有辦一場，來去聽聽看
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