Re: [求救] HPLC分離後的胜肽,合成回來後RT改變

看板Biotech作者 (proky)時間10年前 (2014/03/16 01:11), 編輯推噓2(201)
留言3則, 2人參與, 最新討論串2/2 (看更多)
※ 引述《hsuan7919 (阿頭)》之銘言: : 小弟最近以HPLC將一個發酵產物分離出許多不同分子量的fraction : column:TSK G2000swxl (size exclusion chromatography) : mobile phase:KH2PO4 100 mM + 1M NaCl + 1mM EDTA : detector:UV : 之後將這些fraction拿去以LC-MS/MS鑑定各根fraction中可能存在的序列 : 再分析各根fraction中哪段序列的可信分數為最高 : 將這段選定序列,送去外面生技公司做胜肽合成 : 合成回來的peptide我拿去再以同樣條件HPLC打一次 : 發現此peptide的RT,和我一開始以HPLC分離下來的fraction的RT不同(差很遠) : 有想過是不是溶解度的問題 : 後來我也依照peptide性質以適合的有機溶劑溶解 : 但跑出來結果,和以水溶解沒有差別== : 就分子篩column來說,就算某根fraction內可能的氨基酸序列有數條 : 那RT差一點點或許可以接受 : 但RT差有點多....我真的想不出是什麼原因造成的.... : 而且合成胜肽的peak的RT range也有點寬...不像是正常peak... : 附圖在此https://www.dropbox.com/s/idn79zmeiuw6ro6/%E5%9C%96%E7%89%871.jpg
: 再麻煩各位有經驗的大大幫我解惑了!!!感恩~~ 一般peptide純度會用Reverse phase C18 HPLC 鑑別,建議把原始收的peak與和成的 以RP HPLC分析一次 ,對照RT就可以確定差別 -- Sent from my Android -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 123.240.3.160

03/28 15:57, , 1F
你確定你的真實樣品都沒有PTM嗎?
03/28 15:57, 1F

05/13 22:50, , 2F
可以請問樓上大大,PTM是???
05/13 22:50, 2F

06/23 15:26, , 3F
轉譯後修飾
06/23 15:26, 3F
文章代碼(AID): #1J98d1-r (Biotech)
文章代碼(AID): #1J98d1-r (Biotech)