Re: [求救] 關於BD RACE 的實驗primer合成?
※ 引述《churchfire (別小看我...)》之銘言:
: 已爬文!
: BD SMART RACE cDNA Amplification Kit
: 內附的primer,可以去自己合嗎?因為此kit太貴了!
: 請問板上的各位,有沒有自己合成做出來的經驗??
: 另外酵素使用其他牌的酵素!!
: 如reverse transcriptase的酵素用I牌,RACE PCR再用其他牌的Taq!!!
: 以上希望有經驗的大大,分享一下!!
: 謝謝!!
感謝大家的回覆!!
如果RACE自己合primer並配合他家酵素完成!
我是按照BD clontech的RACE手冊合成primer!
我RT的酵素也是使用clontech SMART Scribe RT
但是我打電話去問廠商他說因為這支酵素是RAN dependent DNA polmerase
要作5'RACE的部份,因為5'端要接dG,所以接上去的部份應為RNA template
所以這條primer必須合成RNA primer!!
這樣RT的效率才會高!當然後續的PCR也會有好的效率!!
所以
問題1
想請教:這幾條primer是僅作一般的DNA primer而已嗎?還是有把它做modify!!
問題2
如果知道基因的ATG起始位置後約900bp,但後面就不知道了!
那可不可以用total RNA 反轉錄合成cDNA後(primer為oligo dT)
設計兩條primer(revese為oilgo dA,forward為基因的前端序列)去PCR嗎?
(以cDNA為template)
如此就可以得到全長和3'UTR?
請問這樣做可以嗎?
--
※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 210.69.175.253
→
10/06 00:39, , 1F
10/06 00:39, 1F
→
10/06 00:40, , 2F
10/06 00:40, 2F
推
10/06 01:00, , 3F
10/06 01:00, 3F
→
10/06 01:00, , 4F
10/06 01:00, 4F
→
10/06 09:51, , 5F
10/06 09:51, 5F
→
10/06 09:57, , 6F
10/06 09:57, 6F
→
10/06 09:59, , 7F
10/06 09:59, 7F
→
10/06 09:59, , 8F
10/06 09:59, 8F
討論串 (同標題文章)
本文引述了以下文章的的內容:
完整討論串 (本文為第 2 之 2 篇):