[求救] 請問有用SYBR SAFE染劑的高手

看板Biotech作者 (霜夜焰蝠)時間15年前 (2010/06/15 23:17), 編輯推噓3(305)
留言8則, 4人參與, 最新討論串1/3 (看更多)
小弟在使用SYBR SAFE染劑時遭遇幾個大問題 材料是LE agarose內染,每100mL加1uL染劑 PCR總反應體積10uL plant genomic DNA 50ng 鎂離子濃度2.5mM dNTP濃度0.3mM 酵素是用taq 首先是背景值過亮的問題一直無法改善 雖然條帶看得見但後面一把油漆刷亮帶就是會讓整個照片不太好看 是不影響判讀但老闆希望能投稿要有漂亮照片... 另外我發現若是電泳時間較長 染劑似乎會有往負極跑的現象 造成膠片上方亮、下方暗的情形 再者SYBR SAFE染的條帶亮度好像跟EtBr比起來就是差了點 雖說實驗室的系統是直接沿用UV燈+EtBr濾鏡 不是SYBR SAFE最大激發波長但302nm也是另一個激發波峰只是比較小一點 在無法更換照相系統的狀況下 有沒有什麼方法可以讓染色效果更好的?? 或是有什麼其他安全染劑是也可以換著試試看的?? 小弟就是不想再用EtBr才會想要以安全染劑來替換 有請板上眾實驗高手們救援 感謝!! -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 122.126.141.236

06/15 23:22, , 1F
忘了說primer濃度是0.3uM 是會擴增產生多條帶的ISSR引子
06/15 23:22, 1F

06/16 00:30, , 2F
用 imageJ 分分看 把可以把全彩 分成三原色
06/16 00:30, 2F

06/16 00:32, , 3F
image>color>split channel
06/16 00:32, 3F

06/16 00:34, , 4F
不過如果你存的是黑白照片就不用分了...
06/16 00:34, 4F

06/16 01:05, , 5F
不知道貴實驗室的照相系統能不能調光圈跟曝光時間
06/16 01:05, 5F

06/16 01:05, , 6F
能的話也可以試看看縮光圈拉長時間
06/16 01:05, 6F

06/16 18:40, , 7F
內染方便但大多都會上亮下暗的 要圖漂亮就外染吧!
06/16 18:40, 7F

06/16 18:41, , 8F
不然跑完電泳 把膠泡在水或buffer一陣子也可改善背景過亮
06/16 18:41, 8F
文章代碼(AID): #1C5vcPVw (Biotech)
文章代碼(AID): #1C5vcPVw (Biotech)