Re: [討論] 大腸桿菌中含多少DNA pol I
※ 引述《ararthur ()》之銘言:
: 想跟大家討論一下
: 現在已經有很多的commercial enzyme、protein等等了
: 有一些早已行之有年的酵素
: 例如DNA polymerase I、DNA ligase等等
: 請問這些酵素能有辦法查到他們在生物體內(ex.大腸桿菌)的總量
: 或濃度大約範圍為何嗎?
http://bionumbers.hms.harvard.edu/
哈佛大學開始把現有的文獻整理 然後把這些數據放在這網站上面
有興趣可以看這篇PAPER
http://www.pnas.org/content/early/2009/12/11/0907732106.short?rss=1
基本上,可以利用的方式像是
假設你養了一管Ecoli,只用glucose當它的營養來源
那它要分裂生長的時候,會發生什麼事情?
由數據可以知道需要兩百萬個glucose
但是細菌並不是只用glucose當作它的生長所需成分,它還需要蛋白質跟酯類
也就說它生長的能量需要多少?
由數據可以知道它需要四百萬的ATP
而由生化數據知道一個glucose在有氧狀態下可以產生30個ATP
也就說,那麼多的醣類被吸收後,有一大堆ATP都不是用在生長上?
那麼那些ATP到哪去了?
最大的猜測就是可能都被細胞膜上的蛋白質花掉了,
因為為了要保持內外某些離子的差異,這些需要耗掉ATP
Anyway 你可以試試這個網站
(以上文章是我翻譯國外的部落格,如果有錯,請跟我說)
: 而欲尋求這樣的資料將會有些什麼盲點嗎?
: 例如這些酵素是inducible的、
: 在生物體內才有對DNA有作用或有結合力的tendency等等
: 或者是這些資料根本不會公佈?
: 這算是我之後可能會考慮做的實驗方向
: 現在是怕如果可行性不高的話...
: 謝謝討論:)
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