Re: [討論] 大腸桿菌中含多少DNA pol I

看板Biotech作者 (黑眼圈...)時間16年前 (2010/04/02 06:37), 編輯推噓2(202)
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※ 引述《ararthur ()》之銘言: : 想跟大家討論一下 : 現在已經有很多的commercial enzyme、protein等等了 : 有一些早已行之有年的酵素 : 例如DNA polymerase I、DNA ligase等等 : 請問這些酵素能有辦法查到他們在生物體內(ex.大腸桿菌)的總量 : 或濃度大約範圍為何嗎? http://bionumbers.hms.harvard.edu/ 哈佛大學開始把現有的文獻整理 然後把這些數據放在這網站上面 有興趣可以看這篇PAPER http://www.pnas.org/content/early/2009/12/11/0907732106.short?rss=1 基本上,可以利用的方式像是 假設你養了一管Ecoli,只用glucose當它的營養來源 那它要分裂生長的時候,會發生什麼事情? 由數據可以知道需要兩百萬個glucose 但是細菌並不是只用glucose當作它的生長所需成分,它還需要蛋白質跟酯類 也就說它生長的能量需要多少? 由數據可以知道它需要四百萬的ATP 而由生化數據知道一個glucose在有氧狀態下可以產生30個ATP 也就說,那麼多的醣類被吸收後,有一大堆ATP都不是用在生長上? 那麼那些ATP到哪去了? 最大的猜測就是可能都被細胞膜上的蛋白質花掉了, 因為為了要保持內外某些離子的差異,這些需要耗掉ATP Anyway 你可以試試這個網站 (以上文章是我翻譯國外的部落格,如果有錯,請跟我說) : 而欲尋求這樣的資料將會有些什麼盲點嗎? : 例如這些酵素是inducible的、 : 在生物體內才有對DNA有作用或有結合力的tendency等等 : 或者是這些資料根本不會公佈? : 這算是我之後可能會考慮做的實驗方向 : 現在是怕如果可行性不高的話... : 謝謝討論:) -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 128.119.52.172

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bionumber 還是太理想化了..實用性目前還是很低
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ron milo 已經回以色列去了 嚴格講不能算是 HMS 的東西
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只是寄生在 HMS SysBio server 上而已.
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04/02 12:59, , 4F
謝謝你:D
04/02 12:59, 4F
文章代碼(AID): #1BjI15QS (Biotech)
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