Re: [求救] 抽大量plasmid,isopropanol沈澱後看不 …

看板Biotech作者 (情人去死)時間16年前 (2009/09/12 17:52), 編輯推噓4(4014)
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今天再次失敗,沈澱後完全看不到pellet Q.Q qiagent protocol: 昨天晚上七點搖兩百毫升,今天早上七點來離心收菌,冰-30度C,中午一點半回來抽 收菌6000xg 15mins 兩次 然後離兩個50ml離心管,在用10ml的P1混合成一管, 加10ml P2 上下微搖晃 6次,室溫等5分鐘,整管變深藍色 加10ml P3 (pre-chilled on ice),倒進過濾裝製裡,等10 mins, 用plunger壓,過濾液,加入2.5ml ER buffer,30 mins on ice, 活化tip-500 DNA binding column by QBT buffer 整個到入tip-500 DNA binding column,wash by QC buffer 30ml*2 elute by QN buffer 15ml,加入isopropanol 10.5ml,RT等10mins 離心11900xg 60mins,--->沒pellet,在底部管壁上沒看到任何白白透明的東西... 唉...已經失敗三次了,到底該怎麼辦 ※ 引述《pent (情人去死)》之銘言: : 我用的是qiagent endofree maxi kit : 搖200ml的菌量,離心後,把全部的菌量用10ml : 的p1混合成一管,完成依照他的protocol : 但是最後,用isopropanol沈澱後,一直都看不到pellet : 第一次測出來,濃度才9ng/ul,根本是沒有抽到 : 做了兩次,都是這樣的結果Q.Q : 請問該怎樣確認到底是中間哪步驟出了問題? : 謝謝 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.109.40.60

09/12 18:29, , 1F
isopropanol後放-20 o/n 再離心看看
09/12 18:29, 1F

09/12 18:40, , 2F
樓上+1。或是用2倍體積ethanol+1%Na Acetate其實也可以
09/12 18:40, 2F

09/12 19:55, , 3F
嗯 我用invitrogen的maxi也是isopropano 放-20
09/12 19:55, 3F

09/12 20:29, , 4F
isopropanol會不會太少 不到0.8V 通常我會放0.8~1 V
09/12 20:29, 4F

09/12 20:31, , 5F
-20 可以增加沉澱量唷 但養200ml 照理說DNA量夠多才是
09/12 20:31, 5F

09/12 23:25, , 6F
步驟看起來跟Qiagen的操作是一樣的 要不要試著用傳統方法
09/12 23:25, 6F

09/12 23:26, , 7F
試一下 就是在P3 incubation之後 高速離心取出上清液
09/12 23:26, 7F

09/12 23:28, , 8F
然後加入isopropanl (0.7V) incubate for 10min 高速離心
09/12 23:28, 8F

09/12 23:29, , 9F
Molecular cloning應該會有詳細的protocol
09/12 23:29, 9F

09/13 02:06, , 10F
考慮是否養菌步驟出了問題 菌是否有長起來 情況好嗎 分一小部
09/13 02:06, 10F

09/13 02:07, , 11F
份抽mini看看
09/13 02:07, 11F

09/13 09:57, , 12F
我是抽midi 加了isopropanol是立刻離心耶 說明書寫的
09/13 09:57, 12F

09/13 09:57, , 13F
我用100ml的菌液抽就可以看到pellet 會不會是菌有問題呀
09/13 09:57, 13F

09/13 17:30, , 14F
你的菌沒帶正確的plasmid?用chloroform粗抽菌液的DNA看一下
09/13 17:30, 14F

09/15 18:27, , 15F
也許是菌有問題...重新從transform做起看看
09/15 18:27, 15F

09/16 10:11, , 16F
謝謝各位<(_._)>
09/16 10:11, 16F

11/11 01:44, , 17F
試一下 就是在P3 i https://muxiv.com
11/11 01:44, 17F

01/03 17:01, 7年前 , 18F
考慮是否養菌步驟出了問 https://muxiv.com
01/03 17:01, 18F
文章代碼(AID): #1AgszDzc (Biotech)
文章代碼(AID): #1AgszDzc (Biotech)