Re: [求救] 從NCBI取得蛋白質序列
※ 引述《inhan (積極進取的小進)》之銘言：
: 大家好，我是資工所的學生
: 畢業論文題目為蛋白質序列分析
: 需要約數千筆蛋白質序列
: 最近程式已寫完，需要真實資料來跑結果
: 因為初次使用NCBI網站
: 不太清楚如何只截取出蛋白質序列的部份 (我猜應該有這功能？？)
: 或是有更好的蛋白質資料庫網站，可以只截取蛋白質序列的部份
: 希望好心人士教我，謝謝大家
現在NCBI跟日歐資料庫早已資料整合了
你進入NCBI後，在search選 Structure
打蛋白名或自己選代碼，NCBI的PDB是用四碼 MMBD是用5碼
1.內建是cn3D
2.可自行下載PDB Viewer，利用這套軟體看PDB檔，選點PDB ID 裡面有 載點
這套軟體功能應該就夠你用了
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/mmdb/mmdbsrv.cgi?uid=33897
舉個例子：1ZMC 是 Human dihydrolipoamide dehydrogenase
裡面自然有分成8個Domain讓你分析
自行玩玩看，若你是資工系的還可以玩裡面有程式檔可供下載
裡面的語法相信你應該不陌生
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你能告訴我...這遠方到底有什麼...
○ ¯￣ ﹉﹊ 我 祈 許 著 . . .
（(∕＼ ¯￣﹉﹎﹊
■Π ﹌ 能 夠 找 到 解 答...
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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 61.62.28.245
※ 編輯: rmp4vu03 來自: 61.62.28.245 (03/26 21:51)
推
03/27 00:01, , 1F
03/27 00:01, 1F
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