Re: [求救] 有沒有這種軟體 關於protein structure

看板Biotech作者 (要死了)時間17年前 (2008/10/13 14:54), 編輯推噓1(105)
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※ 引述《stool (要死了)》之銘言: : 你輸入amino acid sequence : 然後它幫你做protein structure的預測 : 請問有這種軟體嗎? 最好是線上的更方便 : 因為我的論文主要是研究 : 在S-HDAg一個amino acid改變 得到一些phenotype的原因 : 有在猜是protein structure造成 : 想先看看能不能用軟體預測 : 如果有的話請告訴我 謝謝:) 另外想請問 這個protein是可以形成dimer的 能不能predict這個AA change是否會影響dimer的形成? -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.112.133.215

10/13 19:04, , 1F
要用structural modeling 去推測單一AA substitution
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10/13 19:05, , 2F
造成對dimeric interface interaction的影響...
10/13 19:05, 2F

10/13 19:08, , 3F
除非這蛋白已經有solved的co-crystal structure, 那你可以
10/13 19:08, 3F

10/13 19:09, , 4F
用rosetta去算single mutation的delta G,如果連monomeric
10/13 19:09, 4F

10/13 19:13, , 5F
都是計算出來的, 那整體的計算準確度會令人懷疑
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10/22 02:23, , 6F
Discovery Studio軟體中的ZDOCK模組可解決這個問題
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文章代碼(AID): #18yl29nt (Biotech)
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