Re: [求救] 轉RT所加的DTT的功用

看板Biotech作者 (jsi)時間17年前 (2008/08/29 00:12), 編輯推噓4(402)
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※ 引述《SIH0209 (River)》之銘言: 請問大家 在做RT-PCR時 轉RT所加的DTT是有什麼功用?

08/28 01:01,
打開二級結構,使RNA二級結構較少`
08/28 01:01

08/28 10:15,
DTT是常用的還原劑吧? 延遲酵素活性降低的功能...打開2級
08/28 10:15

08/28 10:15,
結構一般不都是高溫處理,在瞬間冷卻就好了??
08/28 10:15

08/28 10:16,
一般RT都是40-42度C在作用,這也是SSIII效果好的原因之一,
08/28 10:16

08/28 10:17,
因為它可以用50度C作用,減少一些二級結構的干擾。
08/28 10:17

08/28 14:08,
^^我是為了應付愛問問題的學妹看書學的,也不一定全對...
08/28 14:08

08/28 14:09,
有錯請不吝指正...
08/28 14:09

08/28 14:12,
ha大說的也應該也是一個原因~呵...之前我們上課有說過!
08/28 14:12

08/28 19:01,
那...可以簡略講解一下DTT打開2級結構的機制嗎? 謝謝囉
08/28 19:01
看到這問題我第一個想到的答案跟handoluslash一樣 我的想法是認為DTT和2-ME具有相同功能,可還原雙硫鍵。 由於這個特性,DTT可用於解開thiolated DNA所形成的dimers結構, 因此推測DTT用在RT步驟,是要解開RNA的二級結構。 不過,有網友說,mRNA不具雙硫鍵。 http://www.protocol-online.org/biology-forums/posts/4770.html (But normally there is no disulfide bond in the mRNAs.) 所以看起來我這個推論,應該是不成立的。 後來看到ookubo的想法,發現我從未考慮到RT酵素活性這一點。 我感到有興趣的是,DTT常用來造成蛋白質變性。 至於它用在延遲酵素活性降低的功能是常見的嗎? 是否在酵素動力學實驗中也會添加DTT呢? 剛剛google發現了第三種說法 http://www.5ibio.com/html/RNA/RNAi/20071018/12918.html 最常用的RNA酶抑制剂Human Placental ribonuclease inhibitor(HPRI)是一种蛋白质 ,可与多种RNA酶(包括RNases A, B, C类)非共价结合成为等摩尔复合物,抑制RNA酶活 性。HPRI需要在DTT存在的条件下保持最大活性。 http://www.promega.com/pnotes/61/6222_30/6222_30_core.pdf 顯示某些RNase inhibitor需在DTT存在下作用。 http://0rz.tw/d84Hi Although RNaseOUT™ requires DTT to be active, it is stable if added to a DTT free buffer and used immediately. If the RNaseOUT™ is diluted in the absence of DTT, and held for any period of time it's activity will suffer. http://www.ambion.com/techlib/resources/superasein/ Figure 3.說明某些RNase inhibitor需在DTT存在下才有較好的作用效果。 當然就會有廠商推出標榜不用DTT,依然很厲害的RNase inhibitor。 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 61.62.20.55

08/29 03:05, , 1F
對喔~忘記去咕狗一下~~感謝!!
08/29 03:05, 1F

08/29 07:04, , 2F
咕狗完,發現配合RNase inhibitor的說法似乎比較多篇...
08/29 07:04, 2F

08/29 07:05, , 3F
看來,很多東西當初在Lab學的時候,答案並非唯一正確...
08/29 07:05, 3F

08/29 07:05, , 4F
學長姐的話,有時候不能全信,科學果然是要"探討"的...
08/29 07:05, 4F

08/29 09:12, , 5F
感謝 ^^
08/29 09:12, 5F

08/29 11:06, , 6F
挖 又學到一項~~~
08/29 11:06, 6F
文章代碼(AID): #18jivq5f (Biotech)
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