Re: [求救] FISH跟microarray有什麼差別
其實根據我的了解
如果說是 "microarray"
其實是看gene的 expression
也就是sample以RNA的型式為主
而送去給廠商做...廠商也會先幫你測RNA的QC
如果要看genomic DNA copy number的不同...應該叫 array -CGH
全名為Array-based comparative genomic hybridization
但J大說的沒錯...
如果用array-CGH去看DNA的copy number...只能看出哪一條染色體的某個片段是否有
duplication or deletion
如果是balance traslocation....就無法在array-CGH上看出差異
這時就要求助於FISH了
※ 引述《jjlee (感覺, 真的存在嗎?)》之銘言:
: 若以分析 DNA 樣品而言...
: 分析特性:
: FISH-> 直接看某特定DNA片段的出現位置, 還可以算多少copy
: Microarray-> 利用數十萬個probes來對應genomic sequence, 分析所有DNA片段,
: 不過只能由訊號得知哪些片段有copy數變化, 但無法知道片段位置改變
: 實驗特性:
: FISH-> probe 去黏 DNA
: Microarray-> fragmented gDNA 去黏 array probes
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